RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
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ECHS1-201ENST00000368547 NR1I3Q14994 352 aa31.96■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 DUOXA2Q1HG44 320 aa31.96■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 DRC7Q8IY82 874 aa31.96■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 SLC38A7Q9NVC3 462 aa31.96■■■□□ 2.71
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ECHS1-201ENST00000368547 TMEM130Q8N3G9 435 aa31.95■■■□□ 2.71
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ECHS1-201ENST00000368547 IMPACTQ9P2X3 320 aa31.95■■■□□ 2.71
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ECHS1-201ENST00000368547 CBWD5Q5RIA9 395 aa31.91■■■□□ 2.7
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ECHS1-201ENST00000368547 BIRC3Q13489 604 aa31.9■■■□□ 2.7
ECHS1-201ENST00000368547 ZACNQ401N2 412 aa31.9■■■□□ 2.7
ECHS1-201ENST00000368547 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa31.9■■■□□ 2.7
ECHS1-201ENST00000368547 NDST4Q9H3R1 872 aa31.9■■■□□ 2.7
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJB4Q9UDY4 337 aa31.9■■■□□ 2.7
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ECHS1-201ENST00000368547 MXI1P50539 228 aa31.89■■■□□ 2.7
ECHS1-201ENST00000368547 KRT39Q6A163 491 aa31.89■■■□□ 2.7
ECHS1-201ENST00000368547 COLGALT2Q8IYK4 626 aa31.89■■■□□ 2.7
ECHS1-201ENST00000368547 CWH43Q9H720 699 aa31.89■■■□□ 2.7
ECHS1-201ENST00000368547 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
ECHS1-201ENST00000368547 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP31.89■■■□□ 2.7
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ECHS1-201ENST00000368547 SCARA3Q6AZY7 606 aa31.89■■■□□ 2.7
ECHS1-201ENST00000368547 PAAF1Q9BRP4 392 aa31.89■■■□□ 2.7
ECHS1-201ENST00000368547 ITGA11Q9UKX5 1188 aa31.89■■■□□ 2.7
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA1671Q9BY89 1806 aa31.88■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 LCHNA4D1U4 455 aa31.88■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 PHACTR2O75167 634 aa31.88■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
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ECHS1-201ENST00000368547 SIX4Q9UIU6 781 aa31.88■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 KRT19P08727 400 aa31.87■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 LRPAP1P30533 357 aa31.87■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 CLCNKBP51801 687 aa31.87■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 MYL7Q01449 175 aa31.87■■■□□ 2.69
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