RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C MRPL25P23369 157 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YCR102CP25608 368 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C SRB4P32569 687 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C MSN4P33749 630 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YOR062CP36025 268 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data1.05□□□□□ -2.24not detected
HDA3YPR179C YHR125WP38831 101 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YMR144WP40214 342 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C SMD3P43321 101 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C LIA1P47120 325 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C GTR2P53290 341 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C INM2Q05533 292 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YPR172WQ06608 200 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C DSF1P0CX08 502 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YNR073CP0CX09 502 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C ERD2P18414 219 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C RPO26P20435 155 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C RPS5P26783 225 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C NUP84P52891 726 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YLR283WQ05867 314 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C MSA1Q08471 629 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YPL257WQ08974 193 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C MHT1Q12525 324 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YPL229WQ99395 206 aa1.05□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C COX5AP00424 153 aa1.04□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C CUE1P38428 203 aa1.04□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C CTR2P38865 189 aa1.04□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C CAT5P41735 233 aa1.04□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C RMR1P53060 241 aa1.04□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YGR026WP53217 278 aa1.04□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YMR279CQ03263 540 aa1.04□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C HTL1Q9URQ5 78 aa1.04□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C ADH3P07246 375 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C PUT1P09368 476 aa1.03□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C SNA3P14359 133 aa1.03□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C DOA4P32571 926 aa1.03□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YPT52P36018 234 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C NRG2P38082 220 aa1.03□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YER085CP40058 173 aa1.03□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C FIS1P40515 155 aa1.03□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C TRM9P49957 279 aa1.03□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data1.03□□□□□ -2.24not detected
HDA3YPR179C DCR2Q05924 578 aa1.03□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C AKR2Q12013 749 aa1.03□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C YHR086W-AQ3E746 53 aa1.03□□□□□ -2.24
HDA3YPR179C CDC10P25342 322 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C VMA11P32842 164 aa1.03□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C VPS21P36017 210 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C FCY21P40039 528 aa1.03□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C RPC17P47076 161 aa1.03□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C HAM1P47119 197 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C ILM1P47155 203 aa1.03□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C ATG39Q06159 398 aa1.03□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C NIP7Q08962 181 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YHR139C-AO13536 103 aa1.02□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C NTF2P33331 125 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C RIB1P38066 345 aa1.02□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C RPF1P38805 295 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YAR068WP39564 161 aa1.02□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C RPA43P46669 326 aa1.02□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C MCM22P47167 239 aa1.02□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YJR149WP47177 404 aa1.02□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C TOS8P53147 276 aa1.02□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C PRM15Q03262 622 aa1.02□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YOR020W-AQ3E824 90 aa1.02□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C SIR4P11978 1358 aa1.02□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C RHO1P06780 209 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C BCY1P07278 416 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C FCY2P17064 533 aa1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YJR056CP47115 236 aa1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C NSA1P53136 463 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YML096WQ04489 525 aa1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C ATO3Q12359 275 aa1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C RPL9AP05738 191 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C RPL24BP24000 155 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C ECM33P38248 429 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C MIC12P38341 106 aa1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C DOG1P38774 246 aa1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C RTR1P40084 226 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C COX15P40086 486 aa1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C PEX17P40155 199 aa1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C RPL9BP51401 191 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C ERV29P53337 310 aa1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C TPO4Q12256 659 aa1.01□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C THP2O13539 261 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C MSW1P04803 379 aa1□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C SPT3P06844 337 aa1□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C GRX2P17695 143 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C PEX4P29340 183 aa1□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C VMA6P32366 345 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C BMH2P34730 273 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YBR063CP38083 404 aa1□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C PRE6P40303 254 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C YIL001WP40560 513 aa1□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C CIS3P47001 227 aa1□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C DAD3P69850 94 aa1□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C MRPS8Q03799 155 aa1□□□□□ -2.25
HDA3YPR179C CDC123Q05791 360 aa1□□□□□ -2.25
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