RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPE3	YPR069C	VPS71	Q03433	280 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	YOR186W	Q08560	144 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	ECM31	P38122	312 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	DDI1	P40087	428 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	YMR252C	Q04814	134 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	HEM25	Q07534	307 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.65	□□□□□ -1.5	not detected
SPE3	YPR069C	RFM1	Q12192	310 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	ORT1	Q12375	292 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	WHI5	Q12416	295 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SPE3	YPR069C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.64	□□□□□ -1.51	not detected
SPE3	YPR069C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	ELO2	P25358	347 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	ATG22	P25568	528 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	PRE4	P30657	266 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	FMC1	P40491	155 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	YFL015C	P43578	164 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	TTI2	P47168	421 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	STD1	Q02794	444 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	MIX17	Q03667	156 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	FRE5	Q08908	694 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	TRM10	Q12400	293 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	REP2	P03872	296 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	PHO85	P17157	305 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	MSN1	P22148	382 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	SFK1	P35735	353 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	TLG1	Q03322	224 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	SPG4	Q04438	115 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	VAM3	Q12241	283 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	QCR7	P00128	127 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	YCR101C	P25607	182 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	UMP1	P38293	148 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	ATG40	Q99325	256 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	PET122	P10355	254 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	AHC2	P25649	128 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	CNE1	P27825	502 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	PAU2	P32612	120 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	NVJ1	P38881	321 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	FIP1	P45976	327 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	YJR120W	P47157	116 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	EFM3	P47163	339 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	HSK3	P69852	69 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	DAL4	Q04895	635 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	YLR283W	Q05867	314 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	LAS17	Q12446	633 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	MED11	Q99278	115 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	ADE8	P04161	214 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	MIG1	P27705	504 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	COQ2	P32378	372 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	YKL063C	P35725	167 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	PMU1	P36069	295 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	ECM4	P36156	370 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	PAM16	P42949	149 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	YFL054C	P43549	646 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	GWT1	P47026	490 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	ILM1	P47155	203 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	ATG17	Q06410	417 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	ASR1	Q06834	288 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	PET18	P25362	215 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	INO2	P26798	304 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	RPD3	P32561	433 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	5.59	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	YJL118W	P47022	219 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	YJR056C	P47115	236 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	HNT2	P49775	206 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	YGL262W	P53054	175 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	SRL4	Q03085	281 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	NEJ1	Q06148	342 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	5.59	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	ATO3	Q12359	275 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SPE3	YPR069C	ARO7	P32178	256 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SPE3	YPR069C	SPS18	P32572	300 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SPE3	YPR069C	YBR137W	P38276	179 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SPE3	YPR069C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
SPE3	YPR069C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52

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