RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	KRE29	P40026	464 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SIM1	P40472	476 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SWC4	P53201	476 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	PDR17	P53844	350 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	MAK3	Q03503	176 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	TDA1	Q03533	586 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	TAZ1	Q06510	381 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	MMT2	Q08970	484 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	USV1	Q12132	391 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	ORT1	Q12375	292 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	RTR2	Q12378	196 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	PEX11	Q12462	236 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SLO1	Q3E784	85 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	ERD1	P16151	362 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	CLB2	P24869	491 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	TFC1	P32367	649 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	UTR4	P32626	227 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	UGX2	P32772	223 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YBL010C	P32788	280 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	PHD1	P36093	366 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	MRPL3	P36516	390 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.45	□□□□□ -1.86	not detected
PAM18	YLR008C	YIL029C	P40538	142 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	CPR7	P47103	393 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YGR151C	P53287	111 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	COS1	P53822	381 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	CWC27	Q02770	301 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YPR098C	Q06089	161 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.45	□□□□□ -1.86	not detected
PAM18	YLR008C	IRC10	Q08118	586 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YLR046C	Q12253	270 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YDL199C	Q12407	687 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	IGO2	Q9P305	131 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.45	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	PMD1	P32634	1753 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SAL1	D6W196	494 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	MRS1	P07266	363 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SCO1	P23833	295 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	ETR1	P38071	380 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SCO2	P38072	301 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	RCK1	P38622	512 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	NVJ1	P38881	321 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	GLE2	P40066	365 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	FAU1	P40099	211 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YIL060W	P40519	144 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	AZF1	P41696	914 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	GLC8	P41818	229 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	PMT4	P46971	762 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	AIM23	P47015	356 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	IKS1	P47042	667 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YPS5	P53057	165 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	TOS8	P53147	276 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	ORM1	P53224	222 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	ARK1	P53974	638 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	HSK3	P69852	69 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SPR6	Q01684	191 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YPL014W	Q02606	381 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YDR476C	Q03362	224 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	TVP15	Q03860	143 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SUE1	Q06524	206 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YLR030W	Q07967	263 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YOL024W	Q08172	172 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SRL2	Q12020	392 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	MRX4	Q12467	430 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YPR064W	Q12492	139 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	BI2	P03873	423 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	MET2	P08465	486 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	URA10	P30402	227 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	OAC1	P32332	324 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SRY1	P36007	326 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YCR041W	P37265	110 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YHK8	P38776	514 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	ECM14	P38836	430 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	MDM31	P38880	579 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86

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