RNA–Protein interactions for RNA: YJL197W

UBP12, Transcript of Ubiquitin-specific protease, yeast

Gene UBP12, Length 3,765 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBP12	YJL197W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	IMP1	P28627	190 aa		3.11	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	SOL2	P37262	315 aa		3.11	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	PBA1	Q05778	276 aa		3.11	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.11	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	DRS2	P39524	1355 aa		3.11	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	PPT2	Q12036	173 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	MDM32	Q12171	622 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	TIP20	P33891	701 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	SBH2	P52871	88 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	VHS1	Q03785	461 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	YOL024W	Q08172	172 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	YPL229W	Q99395	206 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	OAC1	P32332	324 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	ARN2	P38724	620 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	STB1	P42845	420 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	YLR030W	Q07967	263 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	RAX2	Q12465	1220 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	ERG2	P32352	222 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	MIC19	P43594	170 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	YGL235W	P53071	178 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	CRZ1	P53968	678 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	YML096W	Q04489	525 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	COS2	P0CX12	379 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	COS3	P0CX13	379 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	YCR025C	P25352	136 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	ARO7	P32178	256 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	COS4	P43542	379 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	FMP32	P43557	207 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	PRM8	P53174	237 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	RDI1	Q12434	202 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UBP12	YJL197W	CDC50	P25656	391 aa		3.09	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	GGC1	P38988	300 aa		3.09	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	YFH7	P43591	353 aa		3.09	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	YKR041W	P36134	250 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	YER076C	P40049	302 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	AVT6	P40074	448 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	ICE2	P40499	491 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	YGR042W	P53227	271 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	OM14	P38325	134 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	PHO89	P38361	574 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	PLP1	Q04004	230 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	NDD1	Q08887	554 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	IGO2	Q9P305	131 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	YBL059W	P34224	193 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	YGL034C	P53186	121 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	TCA17	P32613	152 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	OXA1	P39952	402 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	RRG9	P40156	214 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	UBC12	P52491	188 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	YNL184C	P53876	108 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	MAK3	Q03503	176 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	TIM17	P39515	158 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	FMP48	P53233	369 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	RMI1	Q02685	241 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	DYN3	Q04949	312 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.07	□□□□□ -1.92	not detected
UBP12	YJL197W	NVJ1	P38881	321 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	COG5	P53951	403 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	SNF4	P12904	322 aa		3.06	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	YIL012W	P40551	113 aa		3.06	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	MRX11	Q03079	207 aa		3.06	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	TRX3	P25372	127 aa		3.06	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	UBC8	P28263	218 aa		3.06	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	CSG2	P35206	410 aa		3.06	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	YAP3	P38749	330 aa		3.06	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	YER189W	P40104	122 aa		3.06	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	ERV29	P53337	310 aa		3.06	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	PET191	Q02772	108 aa		3.06	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	YGL262W	P53054	175 aa		3.05	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	YPR127W	Q06494	345 aa		3.05	□□□□□ -1.92
UBP12	YJL197W	MSA1	Q08471	629 aa		3.05	□□□□□ -1.92

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