RNA–Protein interactions for RNA: YGL248W

PDE1, Transcript of Low-affinity cyclic AMP phosphodiesterase, yeast

Gene PDE1, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDE1	YGL248W	YCR007C	P25354	239 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	MRP49	P32388	137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	AEP1	P32493	518 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	SRY1	P36007	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	LEU5	P38702	357 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	COS8	P38723	381 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	DOG2	P38773	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	DOG1	P38774	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	TRR2	P38816	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	CDC1	P40986	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	EGT2	P42835	1041 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	YFL064C	P43540	174 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	IKS1	P47042	667 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	AVT4	P50944	713 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	TOS8	P53147	276 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	PRM8	P53174	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	YNR048W	P53740	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	YMR320W	Q04897	101 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	LIP2	Q06005	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	YPR202W	Q08993	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	MCT1	Q12283	360 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	HRT3	Q12347	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	PHO13	P19881	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	ATG22	P25568	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	PRY2	P36110	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	MRPL39	P36533	70 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	MRP21	P38175	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	TPN1	P53099	579 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	FLC3	P53121	802 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	YGL101W	P53144	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	YNL184C	P53876	108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	HHT1	P61830	136 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	FMN1	Q03778	218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	TSA2	Q04120	196 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	SPG4	Q04438	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	PEX30	Q06169	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	THI20	Q08224	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	DRS2	P39524	1355 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	SNF4	P12904	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	ERG4	P25340	473 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	TRS65	P32893	560 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	SFK1	P35735	353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
PDE1	YGL248W	YBR220C	P38318	560 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	YEA4	P40004	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	AYR1	P40471	297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	AIM25	P47140	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	UBC12	P52491	188 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	ATP23	P53722	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	ATG39	Q06159	398 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	SHH4	Q06236	168 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	FDH1	Q08911	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	PRM4	Q12498	284 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDE1	YGL248W	TSC11	P40061	1430 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	PHO2	P07269	559 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	SPS100	P13130	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	CAP2	P13517	287 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	YCR100C	P25606	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	PHA2	P32452	334 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	ARN1	P38731	627 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	CHL4	P38907	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	PEX22	P39718	180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	AIM2	P39721	246 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	YFL015C	P43578	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	MIC19	P43594	170 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	HST4	P53688	370 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	ARK1	P53974	638 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	GMC1	Q04399	608 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	MSI1	P13712	422 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	MDM10	P18409	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	COQ3	P27680	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	YMC1	P32331	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	MED6	P38782	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE1	YGL248W	APQ12	P40532	138 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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