RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W YPL119C-AQ3E751 87 aa4.67□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W ISD11Q6Q560 94 aa4.67□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W ALG7P07286 448 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W BGL2P15703 313 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W ART10P18634 518 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W PUT3P25502 979 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W TOA2P32774 122 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W THI2P38141 450 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W YER076CP40049 302 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W FIS1P40515 155 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W HAC1P41546 238 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W ERG25P53045 309 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W HST3P53687 447 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W ABF2Q02486 183 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W GIP3Q03016 1276 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W TRM12Q04235 462 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W ISU2Q12056 156 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W CTF3Q12748 733 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data4.66□□□□□ -1.66not detected
CYK3YDL117W CPT1P17898 393 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W YCR102CP25608 368 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W EMP70P32802 667 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W ROT2P38138 954 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W MIC12P38341 106 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W PRE6P40303 254 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W FKH2P41813 862 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W BIT61P47041 543 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W YJR015WP47090 510 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W SUR7P54003 302 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W SUE1Q06524 206 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W HUT1Q12520 339 aa4.66□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W MGT1P26188 188 aa4.65□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W PPZ2P33329 710 aa4.65□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W PET10P36139 283 aa4.65□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W YBL029WP38201 376 aa4.65□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W YHR033WP38690 423 aa4.65□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W MET30P39014 640 aa4.65□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W YNL194CP40169 301 aa4.65□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W ATG18P43601 500 aa4.65□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W YJL118WP47022 219 aa4.65□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W MTM1P53320 366 aa4.65□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W HHT1P61830 136 aa4.65□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W RSM23Q01163 450 aa4.65□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W UBP16Q02863 499 aa4.65□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W ANT1Q06497 328 aa4.65□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W PAU23Q07987 124 aa4.65□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W PAU17Q12370 124 aa4.65□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
CYK3YDL117W RFA3P26755 122 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W MIG1P27705 504 aa4.65□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W TFA2P36145 328 aa4.65□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W KTR3P38130 404 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W RPL14BP38754 138 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W FMP41P53889 259 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W YMR206WQ03695 313 aa4.65□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W POS5Q06892 414 aa4.65□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W WTM2Q12206 467 aa4.65□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W YKL183C-AQ3E765 70 aa4.65□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W CTA1P15202 515 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W BET2P20133 325 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W PEX34P25584 144 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W GAC1P28006 793 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W UTR5P32630 166 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W RIM2P38127 377 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W MOH1P38191 138 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W MTC4P38335 694 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W AVT7P40501 490 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W BNA2P47125 453 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W YIP1P53039 248 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W RMD9P53140 646 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W SAY1P53324 424 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W RCR2Q03446 210 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W YMR130WQ04223 302 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W POM34Q12445 299 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W IZH4Q99393 312 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W YER039C-AP0CD97 72 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W YSR3P23501 404 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W BUB2P26448 306 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W GLC7P32598 312 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W IML3P38265 245 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W YHR177WP38867 453 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W GCV3P39726 170 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W AZF1P41696 914 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W CAK1P43568 368 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W SCS3P53012 380 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W RSM10Q03201 203 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W ERP1Q05359 219 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W THP1Q08231 455 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W YOS1Q3E834 85 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W YBR126W-AQ8TGU7 68 aa4.64□□□□□ -1.67
CYK3YDL117W TAH1P25638 111 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 60.5 ms