RNA–Protein interactions for RNA: YCL043C

PDI1, Transcript of Protein disulfide isomerase, yeast

Gene PDI1, Length 1,569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDI1	YCL043C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	CKA1	P15790	372 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YMC1	P32331	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	SRB5	P32585	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YEF1	P32622	495 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	TRR2	P38816	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YJR056C	P47115	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	SAE3	P89114	91 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	CYT2	Q00873	224 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	EST3	Q03096	181 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	AVO2	Q04749	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	NAT4	Q04751	285 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	STP3	Q05937	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	HEM25	Q07534	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	CRT10	Q08226	957 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	TPO4	Q12256	659 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YLR118C	Q12354	227 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	AGC1	Q12482	902 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	CBS1	P14066	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	CNE1	P27825	502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	LAC1	P28496	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	RIB5	P38145	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	TRS20	P38334	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	CHS7	P38843	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	GET2	P40056	285 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	LTP1	P40347	161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	AVT4	P50944	713 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YGR012W	P53206	393 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	MRP51	Q02950	344 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	TMA23	Q03525	211 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	COX19	Q3E731	98 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	SGA1	P08019	549 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	PAU19	P0CE85	124 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	PAU21	P0CE86	164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	PAU22	P0CE87	164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	SEC62	P21825	274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	GPI12	P23797	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	CPR4	P25334	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	ADH7	P25377	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	BOS1	P25385	244 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	PAU3	P25610	124 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	POP5	P28005	173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	FAT1	P38225	669 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	GIP2	P40036	548 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	SYS1	P41544	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	MOB2	P43563	287 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	TOS2	P50078	622 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YGL204C	P53089	101 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	ATG33	Q06485	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	CTR3	Q06686	241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	CHO1	P08456	276 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	SNF5	P18480	905 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	HNM1	P19807	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	PET18	P25362	215 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	HOG1	P32485	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	PPZ2	P33329	710 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	MRPS9	P38120	278 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YEL068C	P39977	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YER010C	P40011	234 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	GAT2	P40209	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	CFD1	P40558	293 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	HNT2	P49775	206 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	NIF3	P53081	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YGR042W	P53227	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	RTT103	Q05543	409 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	HTB2	P02294	131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	ADE8	P04161	214 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	STE4	P18851	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	STP22	P25604	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YCR100C	P25606	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	COQ3	P27680	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	CWP1	P28319	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.3 ms