RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 H0Y858 1186 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 F2RL2O00254 374 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BTN3A1O00481 513 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PODXLO00592 558 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 THAP12O43422 761 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBC1D4O60343 1298 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NDST3O95803 873 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IL18BPO95998 194 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MT-ND5P03915 603 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDCP20711 480 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SREBF1P36956 1147 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADCY8P40145 1251 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AFMP43652 599 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RXRGP48443 463 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNJ5P48544 419 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NR1I3Q14994 352 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAB3GAP1Q15042 981 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STILQ15468 1287 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC93Q567U6 631 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VPS53Q5VIR6 699 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRAMD4Q6IC98 578 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPTNQ6XPR3 784 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF783Q6ZMS7 281 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPRED2Q7Z698 418 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AMIGO3Q86WK7 504 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM90A1Q86YD7 464 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ESX1Q8N693 406 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PIK3C3Q8NEB9 887 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ALG3Q92685 438 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SHISA4Q96DD7 197 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC46Q96FV0 321 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CNPPD1Q9BV87 410 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TLR9Q9NR96 1032 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SRRDQ9UH36 339 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM43BA6NCK2 446 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR32O75388 356 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FSBPO95073 299 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNFRSF6BO95407 300 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HPXP02790 462 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GAAP10253 952 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CKMT1AP12532 417 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARFIP2P53365 341 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SETQ01105 290 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CREMQ03060 361 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FOXO1Q12778 655 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC13A2Q13183 592 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAN2A1Q16706 1144 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WDR72Q3MJ13 1102 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MZT2BQ6NZ67 158 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CNKSR3Q6P9H4 555 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UNC13DQ70J99 1090 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF44Q7L0R7 432 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OTOP2Q7RTS6 562 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DTX3Q8N9I9 347 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC30A5Q8TAD4 765 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STYXQ8WUJ0 223 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF480Q8WV37 535 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STON2Q8WXE9 905 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ASB12Q8WXK4 309 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RUBCNQ92622 972 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYFIP2Q96F07 1278 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC120Q96HB5 630 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WDR92Q96MX6 357 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BCO1Q9HAY6 547 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DLL4Q9NR61 685 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RASSF1Q9NS23 344 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LANCL2Q9NS86 450 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBC1D23Q9NUY8 699 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZFP69BQ9UJL9 534 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TISP43B9A030 160 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 B9A039 149 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PIP5K1BO14986 540 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADCY6O43306 1168 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FIBPO43427 364 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TGFB1P01137 390 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MPOP05164 745 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CD1AP06126 327 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CAPN3P20807 821 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRT9P35527 623 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PHKA1P46020 1223 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ERVFRD-1P60508 538 aa5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms