RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIRREL1Q96J84 757 aa5.27□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.27□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP5.27□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa5.27□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDH12Q9NPG4 1184 aa5.27□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRRDQ9UH36 339 aa5.27□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa5.27□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDH23Q9H251 3354 aa5.27□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PQJ5 194 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 M0R2C6 588 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPTXRO95502 500 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 DBHP09172 617 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCL5P13501 91 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP5JP18859 108 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 VCAM1P19320 739 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 SDHBP21912 280 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNGA1P29973 690 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 FLT3LGP49771 235 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 RGS19P49795 217 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 HERVK_113P62684 666 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGEF6Q15052 776 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM110CQ1W6H9 321 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM177Q53S58 311 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCE3BQ5TA77 95 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 WWC2Q6AWC2 1192 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 OTOP3Q7RTS5 596 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 STRA8Q7Z7C7 330 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPICE1Q8N0Z3 855 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHMP4CQ96CF2 233 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 FSD1Q9BTV5 496 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPB41L1Q9H4G0 881 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 RXFP1Q9HBX9 757 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 TXNRD2Q9NNW7 524 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 CATSPERZQ9NTU4 200 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 ECHDC1Q9NTX5 307 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIT1Q9Y3P8 196 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 EYSQ5T1H1 3165 aa5.26□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYH7BA7E2Y1 1941 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPAA1O43292 621 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 DGKIO75912 1065 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNAT1P11488 350 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 AKR1B1P15121 316 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 SOX5P35711 763 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARL4AP40617 200 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 TDO2P48775 406 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 MECP2P51608 486 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 BACE1P56817 501 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 ICA1Q05084 483 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 OSTM1Q86WC4 334 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 CERS3Q8IU89 383 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 AMOTL1Q8IY63 956 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3RF2Q8TEC5 729 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 COA7Q96BR5 231 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 ORAI3Q9BRQ5 295 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 PORCNQ9H237 461 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 ROBO3Q96MS0 1386 aa5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 TANC1Q9C0D5 1861 aa5.24□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.24□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 CBX4O00257 560 aa5.24□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNK3O14649 394 aa5.24□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSTA4O15217 222 aa5.24□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 SGSM2O43147 1006 aa5.24□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRDM1O75626 825 aa5.24□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 AMY2AP04746 511 aa5.24□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 AMY2BP19961 511 aa5.24□□□□□ -1.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 MX1P20591 662 aa5.24□□□□□ -1.57
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