RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 GUCY2FP51841 1108 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-201ENST00000211413 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-201ENST00000211413 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-201ENST00000211413 TC2NQ8N9U0 490 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-201ENST00000211413 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-201ENST00000211413 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-201ENST00000211413 RECQL4O94761 1208 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 CBX1P83916 185 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 ZFP42Q96MM3 310 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 ACAP3Q96P50 834 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 OGFRQ9NZT2 677 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 LGALS16A8MUM7 142 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 TIMP1P01033 207 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 NFICP08651 508 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 TNNI1P19237 187 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 GRM5P41594 1212 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 GOLGA8FQ08AF8 430 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 PSMD6Q15008 389 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 CLTAP09496 248 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 KCNMA1Q12791 1236 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 JADE1Q6IE81 842 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 USP38Q8NB14 1042 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 FNBP1Q96RU3 617 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 SQORQ9Y6N5 450 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA0355O15063 1070 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 ACTN1P12814 892 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 FMO5P49326 533 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 CHST12Q9NRB3 414 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 MIOSQ9NXC5 875 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 TTC26A0AVF1 554 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 ENPP3O14638 875 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 SLC9A1P19634 815 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 DNAI1Q9UI46 699 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 EPHB6O15197 1021 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 MAPK13O15264 365 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 SV2AQ7L0J3 742 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 TNS4Q8IZW8 715 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 TMC2Q8TDI7 906 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 SEMA4DQ92854 862 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 BADQ92934 168 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 RGS18Q9NS28 235 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 A0A0U1RQF3 1178 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 C9IYK1 514 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 CXCL10P02778 98 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 MLH1P40692 756 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 ELF2Q15723 593 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 SEPT8Q92599 483 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 GAD1Q99259 594 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 FGFR1P11362 822 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 ITGA4P13612 1032 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 PBX1P40424 430 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 GATMP50440 423 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 GJB7Q6PEY0 223 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 RABGGTAQ92696 567 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 SNX27Q96L92 541 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 PANX2Q96RD6 677 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 CGRRF1Q99675 332 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PRRT1-201ENST00000211413 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.09■□□□□ 0.81
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