RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q CTR2P38865 189 aa0.33□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q NAS2P40555 220 aa0.33□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL9BP51401 191 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q NBP35P52920 328 aa0.33□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q NEJ1Q06148 342 aa0.33□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q SFH1Q06168 426 aa0.33□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q FLO9P39712 1322 aa0.33□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q SEC22P22214 214 aa0.32□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q VMA11P32842 164 aa0.32□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q SSH1P38353 490 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q HIS2P38635 335 aa0.32□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q PEX18P38855 283 aa0.32□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q MNN9P39107 395 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q SWS2P53937 143 aa0.32□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q UBC7Q02159 165 aa0.32□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPL162CQ12042 273 aa0.32□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q PER33Q12144 273 aa0.32□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q BBP1Q12365 385 aa0.32□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR462WO13556 202 aa0.31□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q UGA1P17649 471 aa0.31□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPC25P35718 212 aa0.31□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q YEL075CP39972 122 aa0.31□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q YER189WP40104 122 aa0.31□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q TOS8P53147 276 aa0.31□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q CPD1P53314 239 aa0.31□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q FAR8Q05040 523 aa0.31□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q YBL008W-AQ3E821 79 aa0.31□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPC40P07703 335 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q QCR8P08525 94 aa0.3□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q PET9P18239 318 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q SMI1P32566 505 aa0.3□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q TMA19P35691 167 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data0.3□□□□□ -2.36not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q VPS45P38932 577 aa0.3□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGL185CP53100 379 aa0.3□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q MAL13P53338 473 aa0.3□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPP2Q02521 185 aa0.3□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q VBA1Q04301 562 aa0.3□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q RRG8Q06109 277 aa0.3□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPR011CQ12251 326 aa0.3□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPL119C-AQ3E751 87 aa0.3□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q MSW1P04803 379 aa0.29□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q YER076CP40049 302 aa0.29□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q JHD2P47156 728 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q MGR3Q04472 501 aa0.29□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q BCP1Q06338 283 aa0.29□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q ARR2Q06597 130 aa0.29□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q VAC14Q06708 880 aa0.29□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q CYR1P08678 2026 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q RRS1Q08746 203 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q GPI12P23797 304 aa0.27□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q FZO1P38297 855 aa0.27□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHR180WP38868 163 aa0.27□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q MNT4P53745 580 aa0.27□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDR124WQ04608 324 aa0.27□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q SIR4P11978 1358 aa0.27□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPP0P05317 312 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q GRX2P17695 143 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q YEL067CP39978 195 aa0.26□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q LOC1P43586 204 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q TPO4Q12256 659 aa0.26□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q SME1Q12330 94 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q STH1P32597 1359 aa0.26□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q BIG1P38813 335 aa0.25□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q RIO2P40160 425 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q MPP6P53725 186 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q HEM25Q07534 307 aa0.25□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q GCD2P12754 651 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q NSP1P14907 823 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q POF1P25576 258 aa0.24□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q CSM1P25651 190 aa0.24□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q TIR3P40552 269 aa0.24□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q RMR1P53060 241 aa0.24□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q GTR2P53290 341 aa0.24□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q CUR1Q06469 252 aa0.24□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERG24P32462 438 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q HSM3P38348 480 aa0.23□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q FIS1P40515 155 aa0.23□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRH4P53166 561 aa0.23□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q SNF8Q12483 233 aa0.23□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q SNA3P14359 133 aa0.22□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q FRS2P15625 503 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q MEI4P29467 408 aa0.22□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q FZF1P32805 299 aa0.22□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q RSM25P40496 264 aa0.22□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q DSN1P40568 576 aa0.22□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL33BP41056 107 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGL034CP53186 121 aa0.22□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL260CP53846 198 aa0.22□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q ANT1Q06497 328 aa0.22□□□□□ -2.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q SSA3P09435 649 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q PBN1P25580 416 aa0.21□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q MSA2P36157 363 aa0.21□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q RRF1P38771 230 aa0.21□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGL159WP53110 370 aa0.21□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC14Q00684 551 aa0.21□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q GOT1Q03554 138 aa0.21□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q ARV1Q06541 321 aa0.21□□□□□ -2.38
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