RNA–Protein interactions for RNA: YKL209C

STE6, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene STE6, Length 3,873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE6	YKL209C	PCL7	P40186	285 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	FMP48	P53233	369 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YLR152C	P54072	576 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	ECM18	Q04623	453 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	MSC3	Q05812	728 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	OSW1	Q08692	278 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	SNC2	P33328	115 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	GPI18	P38211	433 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YHL037C	P38733	133 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	SPO73	P40031	143 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	HIS6	P40545	261 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YFL054C	P43549	646 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	POP6	P53218	158 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YGR151C	P53287	111 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	HSK3	P69852	69 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	AAC1	P04710	309 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	APA2	P22108	325 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	IPT1	P38954	527 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	RMD6	P39975	231 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	STB1	P42845	420 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	TAF4	P50105	388 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	TYW3	P53177	273 aa		2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	SOD2	P00447	233 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	FAR1	P21268	830 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	AHC2	P25649	128 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YKL063C	P35725	167 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	SRY1	P36007	326 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	SAP30	P38429	201 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	SIT1	P39980	628 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	RMR1	P53060	241 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	TGS1	Q12052	315 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	SWT1	Q12104	458 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YBR241C	P38142	488 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	RPP1	P38786	293 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YJL213W	P40896	331 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	MDJ2	P42834	146 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	CRH1	P53301	507 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	OST6	Q03723	332 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YDR391C	Q04170	232 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YLR031W	Q07978	186 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	ELO2	P25358	347 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YCR061W	P25639	631 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	OAC1	P32332	324 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	SKG1	P36169	355 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	UMP1	P38293	148 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YLF2	P38746	405 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	FMP33	P46998	180 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	XPT1	P47165	209 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	WSC2	P53832	503 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	COG5	P53951	403 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	MAK3	Q03503	176 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	NEJ1	Q06148	342 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	SOG2	Q08817	791 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	INP53	Q12271	1107 aa		2.69	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	SAG1	P20840	650 aa		2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	LSB5	P25369	354 aa		2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	IMP1	P28627	190 aa		2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	SHE1	P38200	338 aa		2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	CCZ1	P38273	704 aa		2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.68	□□□□□ -1.98	not detected
STE6	YKL209C	QDR1	P40475	563 aa		2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	MSS2	P40990	351 aa		2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	NIT3	P49954	291 aa		2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	CAB4	P53332	305 aa		2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	SMP3	Q04174	516 aa		2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	TMA17	Q12513	150 aa		2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	MTC7	P32633	139 aa		2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	YND1	P40009	630 aa		2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	CTK2	P46962	323 aa		2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	BNA1	P47096	177 aa		2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
STE6	YKL209C	RFU1	Q08003	200 aa		2.68	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 59.7 ms