RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	BBP1	Q12365	385 aa		0.76	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		0.76	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	SEC22	P22214	214 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YGL010W	P25338	174 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	0.75	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	COS8	P38723	381 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	0.75	□□□□□ -2.29	not detected
YJL135W	YJL135W	DSN1	P40568	576 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	KAP114	P53067	1004 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	CTF19	Q02732	369 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	OST6	Q03723	332 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YDR124W	Q04608	324 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	DCN1	Q12395	269 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	EMP46	Q12396	444 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	Q0255	P03881	472 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YOL162W	P0CF19	215 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	MDH2	P22133	377 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	VPS3	P23643	1011 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	CIS3	P47001	227 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YJR079W	P47126	109 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	GOT1	Q03554	138 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	DSF1	P0CX08	502 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YNR073C	P0CX09	502 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	PEX4	P29340	183 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	QRI5	P32344	111 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YBR220C	P38318	560 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	RRF1	P38771	230 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YHR125W	P38831	101 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	AVT2	P39981	480 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YER189W	P40104	122 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	MRH4	P53166	561 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YGL034C	P53186	121 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YGR026W	P53217	278 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YMR279C	Q03263	540 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YDR209C	Q03480	137 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	ATG17	Q06410	417 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.73	□□□□□ -2.29	not detected
YJL135W	YJL135W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	ATO3	Q12359	275 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	SNF8	Q12483	233 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	SWI1	P09547	1314 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YLR462W	O13556	202 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YKR104W	P0CE69	306 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.72	□□□□□ -2.29	not detected
YJL135W	YJL135W	JEN1	P36035	616 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	MSA2	P36157	363 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	MRPL37	P36532	105 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	MRPL39	P36533	70 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	FZO1	P38297	855 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	DSE2	P38844	325 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	SVP26	P38869	228 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	PET100	P38958	111 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YEL075C	P39972	122 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	SNZ3	P43545	298 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	COX20	Q04935	205 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	FAR8	Q05040	523 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	YPR098C	Q06089	161 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	COQ10	Q08058	207 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	AKR2	Q12013	749 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJL135W	YJL135W	COX2	P00410	251 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	COX5A	P00424	153 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	DAL82	P21705	255 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	VMA11	P32842	164 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	0.71	□□□□□ -2.3	not detected
YJL135W	YJL135W	BMT5	P40493	336 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	ERG25	P53045	309 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YGL159W	P53110	370 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	YGR219W	P53307	113 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	BUD25	P85052	153 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	MRPS8	Q03799	155 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	SPG4	Q04438	115 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	UBR2	Q07963	1872 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	DDI2	P0CH63	225 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	DDI3	P0CH64	225 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	SGE1	P33335	543 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	UPS2	P35200	230 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	CTR2	P38865	189 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	FIS1	P40515	155 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJL135W	YJL135W	PRM10	P42946	383 aa		0.7	□□□□□ -2.3

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