RNA–Protein interactions for RNA: YGR048W

UFD1, Transcript of Substrate-recruiting cofactor of the Cdc48p-Npl4p-Ufd1p segregase, yeastyeast

Gene UFD1, Length 1,086 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFD1YGR048W ATG39Q06159 398 aa7.31□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W PAU23Q07987 124 aa7.31□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W CSI2Q08054 341 aa7.31□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W HRD1Q08109 551 aa7.31□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W NAT5Q08689 176 aa7.31□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W LEU9Q12166 604 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W PAU17Q12370 124 aa7.31□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa7.3□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W TY2A-CP25383 438 aa7.3□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W PUT3P25502 979 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W YCR087C-AP37263 153 aa7.3□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W YHR177WP38867 453 aa7.3□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W RMD8P43620 662 aa7.3□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W ALK1P43633 760 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W ACT1P60010 375 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W TY2A-DR2Q03483 438 aa7.3□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W YML018CQ03730 393 aa7.3□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W HLR1Q04429 423 aa7.3□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W GIM5Q04493 163 aa7.3□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W TY2A-BQ12260 438 aa7.3□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W TY2A-OR2Q12293 438 aa7.3□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W TY2A-DR1Q12392 438 aa7.3□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W TY2A-OR1Q12439 438 aa7.3□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W SLO1Q3E784 85 aa7.3□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W TY2A-DR3Q99303 438 aa7.3□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W STT4P37297 1900 aa7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W STF1P01098 86 aa7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W MSW1P04803 379 aa7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W PAU2P32612 120 aa7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W PRY2P36110 329 aa7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W REG2P38232 338 aa7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W MET30P39014 640 aa7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W PUG1P40100 303 aa7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W PCL7P40186 285 aa7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W ELO3P40319 345 aa7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W YGR149WP48236 432 aa7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W FLC3P53121 802 aa7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W SMM1P53720 384 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W OAZ1Q02803 292 aa7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W YDR248CQ03786 193 aa7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W YMR252CQ04814 134 aa7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W YLR456WQ06199 204 aa7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W TGL5Q12043 749 aa7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data7.29□□□□□ -1.24not detected
UFD1YGR048W WIP1Q2V2P8 89 aa7.29□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W TDH2P00358 332 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W COX5AP00424 153 aa7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W THI2P38141 450 aa7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W VID24P38263 362 aa7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W RPF1P38805 295 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W TAT2P38967 592 aa7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W YEL057CP39983 233 aa7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W PAU5P43575 122 aa7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W YAR1P46683 200 aa7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W PFD1P46988 109 aa7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W UBX6P47049 396 aa7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W YGL262WP53054 175 aa7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W SLG1P54867 378 aa7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W MCH1Q07376 486 aa7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W GUD1Q07729 489 aa7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W AAD4Q07747 329 aa7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W SRL2Q12020 392 aa7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W VAM3Q12241 283 aa7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W YGR161W-CQ3E744 92 aa7.28□□□□□ -1.24
UFD1YGR048W SAL1D6W196 494 aa7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W MF(ALPHA)2P32435 120 aa7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W UTR5P32630 166 aa7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W PHO11P35842 467 aa7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W PHO12P38693 467 aa7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W YHL044WP38727 235 aa7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W TRR2P38816 342 aa7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W NSA2P40078 261 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W PHS1P40857 217 aa7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W TIS11P47977 285 aa7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W TYW3P53177 273 aa7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W VHT1P53241 593 aa7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W YGR066CP53242 292 aa7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W YPL080CQ02826 108 aa7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W MET31Q03081 177 aa7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W CGI121Q03705 181 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W PKR1Q03880 122 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W RRP45Q05636 305 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W GRX8Q05926 109 aa7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W RDL1Q12305 139 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W PST1Q12355 444 aa7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W ZPS1Q12512 249 aa7.27□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W DAL82P21705 255 aa7.26□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W AIM17P23180 465 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W GPI12P23797 304 aa7.26□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W RBK1P25332 333 aa7.26□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W ELO2P25358 347 aa7.26□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W PHO88P38264 188 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W SAF1P38352 637 aa7.26□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W MNL1P38888 796 aa7.26□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W YHR210CP38893 341 aa7.26□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W THG1P53215 237 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W YGR126WP53274 230 aa7.26□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W YAP1802P53309 568 aa7.26□□□□□ -1.25
UFD1YGR048W EFM6P53970 246 aa7.26□□□□□ -1.25
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