RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 NOMO1Q15155 1222 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 MST1LQ2TV78 715 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 INTUQ9ULD6 942 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 NCOA2Q15596 1464 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 CUX1P39880 1505 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 PRDM2Q13029 1718 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 A0A1W2PRX2 142 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 CCDC154A6NI56 674 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 SEPT2Q15019 361 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 MLC1Q15049 377 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 Q6ZVL8 140 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 C14orf80Q86SX3 495 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 PRR18Q8N4B5 295 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 ZNF480Q8WV37 535 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 RABGGTAQ92696 567 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 DPF2Q92785 391 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 C8orf48Q96LL4 319 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 GPHA2Q96T91 129 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.4□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 NCAPD3P42695 1498 aa6.4□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 PDCP20941 246 aa6.39□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 CRHR2Q13324 411 aa6.39□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.39□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.39□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 USP45Q70EL2 814 aa6.39□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.39□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 TTC8Q8TAM2 541 aa6.39□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 HDAC10Q969S8 669 aa6.39□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.39□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.39□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 OFD1O75665 1012 aa6.38□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 ENDOD1O94919 500 aa6.38□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 GASTP01350 101 aa6.38□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 ECHS1P30084 290 aa6.38□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 TUBA3CQ13748 450 aa6.38□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 MINDY4Q4G0A6 757 aa6.38□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 CCDC181Q5TID7 509 aa6.38□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.38□□□□□ -1.39
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TRDN-204ENST00000542443 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.38□□□□□ -1.39
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TRDN-204ENST00000542443 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.38□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 BCO1Q9HAY6 547 aa6.38□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.38□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.38□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.38□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.38□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa6.38□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 CFTRP13569 1480 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 NRP1O14786 923 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 AP1G1O43747 822 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 GYPEP15421 78 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 HSPA6P17066 643 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 ATF3P18847 181 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 CRHR1P34998 444 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 SLC6A9P48067 706 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 IL10RAQ13651 578 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 KRT40Q6A162 431 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 OR7D4Q8NG98 312 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 LRGUKQ96M69 825 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 HFM1A2PYH4 1435 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 AKNAQ7Z591 1439 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 UACAQ9BZF9 1416 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 RNF123Q5XPI4 1314 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 CYP27B1O15528 508 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 ANP32CO43423 234 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-204ENST00000542443 DTNBO60941 627 aa6.36□□□□□ -1.39
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