RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeastyeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3YPR094W RPS0AP32905 252 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W TMA19P35691 167 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W RCN1P36054 211 aa-0.63□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W PRS4P38063 326 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YHR125WP38831 101 aa-0.63□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W PEX18P38855 283 aa-0.63□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data-0.63□□□□□ -2.51not detected
RDS3YPR094W YFL065CP43539 102 aa-0.63□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W JHD2P47156 728 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W PEX31P53203 462 aa-0.63□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W ASI3P53983 676 aa-0.63□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W NEJ1Q06148 342 aa-0.63□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YMR316C-AI2HB70 103 aa-0.64□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W COX5AP00424 153 aa-0.64□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W PET494P07390 489 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W RDS1P25611 832 aa-0.64□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W SUA5P32579 426 aa-0.64□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YKL162CP36052 402 aa-0.64□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W NPT1P39683 429 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W SWC4P53201 476 aa-0.64□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YGR026WP53217 278 aa-0.64□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YGR168CP53293 376 aa-0.64□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W OKP1P53298 406 aa-0.64□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W VPS60Q03390 229 aa-0.64□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YLR030WQ07967 263 aa-0.64□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W SLD7Q08457 257 aa-0.64□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W PSY3Q12318 242 aa-0.64□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YPR064WQ12492 139 aa-0.64□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W FMP49A0A023PZB3 126 aa-0.65□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W INH1P01097 85 aa-0.65□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W CAM1P29547 415 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W VMA11P32842 164 aa-0.65□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W EBP2P36049 427 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W RXT2P38255 430 aa-0.65□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YSW1P38280 609 aa-0.65□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YEA4P40004 342 aa-0.65□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W CTF19Q02732 369 aa-0.65□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W ATC1Q04005 294 aa-0.65□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W ARR2Q06597 130 aa-0.65□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W PBP4Q07362 185 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YPR011CQ12251 326 aa-0.65□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YDR262WQ12331 272 aa-0.65□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W BBP1Q12365 385 aa-0.65□□□□□ -2.51
RDS3YPR094W YHR139C-AO13536 103 aa-0.66□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W STE3P06783 470 aa-0.66□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W SEC22P22214 214 aa-0.66□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W CWP1P28319 239 aa-0.66□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W SPT4P32914 102 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W TVP38P36164 337 aa-0.66□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W COS8P38723 381 aa-0.66□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W INA22P40576 216 aa-0.66□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W MPP10P47083 593 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W ARP5P53946 755 aa-0.66□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YMR279CQ03263 540 aa-0.66□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YMR209CQ03648 457 aa-0.66□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W VPS20Q04272 221 aa-0.66□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W TAF9Q05027 157 aa-0.66□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W ANT1Q06497 328 aa-0.66□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YDL121CQ07541 149 aa-0.66□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W EMP46Q12396 444 aa-0.66□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W IZH4Q99393 312 aa-0.66□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W MSW1P04803 379 aa-0.67□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W RPL9AP05738 191 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W MSS116P15424 664 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W STP22P25604 385 aa-0.67□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YHL049CP38722 271 aa-0.67□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W FET3P38993 636 aa-0.67□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W GAA1P39012 614 aa-0.67□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W TIR3P40552 269 aa-0.67□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W RPL9BP51401 191 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W BOL2P53082 120 aa-0.67□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YGL185CP53100 379 aa-0.67□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W MPP6P53725 186 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YNL146WP53906 100 aa-0.67□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W SIR4P11978 1358 aa-0.68□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W RPL6BP05739 176 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W GRX2P17695 143 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W MNE1P24720 663 aa-0.68□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W SER33P40510 469 aa-0.68□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W RPL33BP41056 107 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W RPA34P47006 233 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YAE1P47118 141 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W IBA57P47158 497 aa-0.68□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W SRB7P47822 140 aa-0.68□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W HEM25Q07534 307 aa-0.68□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W SAM4Q08985 325 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W APC9Q12107 265 aa-0.68□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W TAO3P40468 2376 aa-0.69□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W RPL4AP10664 362 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W PEX3P28795 441 aa-0.69□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W YKL063CP35725 167 aa-0.69□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W RPC37P36121 282 aa-0.69□□□□□ -2.52
RDS3YPR094W MSA2P36157 363 aa-0.69□□□□□ -2.52
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