RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeastyeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPT53YNL093W YBR255C-AQ3E776 120 aa3.61□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W TY1B-DR4Q07793 1604 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W MTF1P14908 341 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W NUP1P20676 1076 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W PPH21P23594 369 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W ZRT1P32804 376 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W NTF2P33331 125 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W CBP4P37267 147 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W RPL32P38061 130 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W RPF1P38805 295 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W AYR1P40471 297 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W MOB1P40484 314 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W GTT1P40582 234 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W MIC19P43594 170 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W ARO8P53090 500 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W RSM27P53305 110 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W MAL13P53338 473 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W TMA23Q03525 211 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YMR206WQ03695 313 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W FMN1Q03778 218 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W NUP53Q03790 475 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W MSS11Q03825 758 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W VBA1Q04301 562 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W TEN1Q07921 160 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YLR030WQ07967 263 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W AIM39Q08223 395 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W RKI1Q12189 258 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W RNH203Q12338 110 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W LYS2P07702 1392 aa3.6□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W PEP4P07267 405 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W RPL12BP0CX54 165 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W PRE1P22141 198 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W BUB3P26449 341 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W PEX4P29340 183 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W ACB1P31787 87 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W SFC1P33303 322 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W MRPS5P33759 307 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W ECM15P35195 104 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YOR062CP36025 268 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YBR241CP38142 488 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W RPS20P38701 121 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data3.59□□□□□ -1.83not detected
YPT53YNL093W SMB1P40018 196 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YIA6P40556 373 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W HAC1P41546 238 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W PMT4P46971 762 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W CPR7P47103 393 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W SWC4P53201 476 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W FRE4P53746 719 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W KTR5P53966 522 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W ERG5P54781 538 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W AIM36Q03798 255 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W GMC1Q04399 608 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W TAF9Q05027 157 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W ECI1Q05871 280 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W SEI1Q06058 285 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YOL024WQ08172 172 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YOL073CQ08232 322 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W RRS1Q08746 203 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W TRM10Q12400 293 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W YER175W-AQ8TGU4 54 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W SAS5Q99314 248 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W IGO2Q9P305 131 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W BI3Q9ZZW7 517 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W KRE5P22023 1365 aa3.59□□□□□ -1.83
YPT53YNL093W TY1B-HO13535 1793 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SPS2P08459 502 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YOL163WP0CF20 169 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W GCN3P14741 305 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W GRX2P17695 143 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SAT4P25333 603 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W POF1P25576 258 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W PEX34P25584 144 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W OAC1P32332 324 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W QRI5P32344 111 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W RNP1P32385 249 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MRP49P32388 137 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W KTI12P34253 313 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SKG1P36169 355 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MRPL28P36527 147 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W ECM33P38248 429 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YAL037WP39728 267 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SHO1P40073 367 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YPS6P40583 537 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W BUL1P48524 976 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W TRM9P49957 279 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W PMT5P52867 743 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MRM2P53123 320 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W LST7P53237 242 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MRPS35P53292 345 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MTM1P53320 366 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YNR062CP53748 327 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W HCH1P53834 153 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W PDR17P53844 350 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YNL184CP53876 108 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SUR7P54003 302 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SLG1P54867 378 aa3.58□□□□□ -1.84
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