RNA–Protein interactions for RNA: YKL038W

RGT1, Transcript of Glucose-responsive transcription factor, yeast

Gene RGT1, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGT1	YKL038W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
RGT1	YKL038W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	PSF1	Q12488	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	SFG1	Q12507	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	PHO2	P07269	559 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	GPI12	P23797	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	DOA1	P36037	715 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	SAF1	P38352	637 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	SFB3	P38810	929 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YJR120W	P47157	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	BOL2	P53082	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	PUS2	P53167	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	IRC15	Q02733	499 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	SWM1	Q12379	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	EXG2	P52911	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	CSM4	Q08955	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	ERV2	Q12284	196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	SRM1	P21827	482 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	PRE8	P23639	250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	VMA3	P25515	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	PHO11	P35842	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	RRN10	P38204	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	PHO12	P38693	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	IRC7	P43623	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YGR117C	P53270	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YGR151C	P53287	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	ATC1	Q04005	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	MSF1	P08425	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YCR099C	P25657	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	FMO1	P38866	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	GAB1	P41733	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	PFD1	P46988	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	SEC17	P32602	292 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	RTG1	P32607	177 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	IME4	P41833	600 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	BNA1	P47096	177 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	KXD1	P53158	218 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	INP1	Q03694	420 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	CNL1	Q06333	122 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	UPS2	P35200	230 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	YPC1	P38298	316 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	SHO1	P40073	367 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	SRL2	Q12020	392 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RGT1	YKL038W	UGX2	P32772	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	AYR1	P40471	297 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YIL089W	P40500	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	MTL1	P53214	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	AVO2	Q04749	426 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	TDA6	Q06466	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	TRM13	Q12383	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	MNS1	P32906	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	SCD5	P34758	872 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	MRP21	P38175	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	FET4	P40988	552 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	NPY1	P53164	384 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	VHT1	P53241	593 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	DCI1	Q08558	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	PBN1	P25580	416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	SSH4	P32343	579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	VRP1	P37370	817 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	MRPS9	P38120	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
RGT1	YKL038W	YGL204C	P53089	101 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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