RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335478.4

ANKRD18DP-201, Transcript of ankyrin repeat domain 18D, pseudogene, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD18DP, Length 2,171 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 PSEN1P49768 467 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ARHGAP1Q07960 439 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CAPSQ13938 189 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 NAB2Q15742 525 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 USP37Q86T82 979 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 KATNBL1Q9H079 304 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 EXTL3O43909 919 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 MARK3P27448 753 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 DRP2Q13474 957 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 LAMC2Q13753 1193 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 FAM110CQ1W6H9 321 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 KRT39Q6A163 491 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 GPR142Q7Z601 462 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 FAM76AQ8TAV0 307 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 TCP11Q8WWU5 503 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CCDC127Q96BQ5 260 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 NAGPAQ9UK23 515 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ATP8B3O60423 1300 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ZNF233A6NK53 670 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ENC1O14682 589 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 MOCS3O95396 460 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CCDC172P0C7W6 258 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 GRB14Q14449 540 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 SYT11Q9BT88 431 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 FAM169AQ9Y6X4 670 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 BTNL10A8MVZ5 291 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 LRRN2O75325 713 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CCT5P48643 541 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 LIG3P49916 1009 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CLDN10P78369 228 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 VPS36Q86VN1 386 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 SLC30A5Q8TAD4 765 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 OLIG1Q8TAK6 271 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 KAT2BQ92831 832 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 FAM213AQ9BRX8 229 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 SAR1BQ9Y6B6 198 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 TRPM7Q96QT4 1865 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 HBP1O60381 514 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 TOMM70O94826 608 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 IRAK1P51617 712 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 GPC3P51654 580 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 KIAA0753Q2KHM9 967 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ARHGEF19Q8IW93 802 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 HAPLN2Q9GZV7 340 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CXorf56Q9H5V9 222 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 HDAC6Q9UBN7 1215 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 GH1P01241 217 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 GGCXP38435 758 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 EFNA5P52803 228 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 KIF22Q14807 665 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 SEMA4DQ92854 862 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 NOX5Q96PH1 765 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 KLRC1P26715 233 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 MAPK4P31152 587 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 PPFIA1Q13136 1202 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ARHGAP44Q17R89 818 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 SKIDA1Q1XH10 827 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 PLEKHH3Q7Z736 793 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 DPP9Q86TI2 863 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 SMC1BQ8NDV3 1235 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ALS2CR12Q96Q35 445 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 PACSIN1Q9BY11 444 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ERAP1Q9NZ08 941 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 A0A0B4J269 797 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 EDN1P05305 212 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 PRLRP16471 622 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 MNAT1P51948 309 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 PSMD6Q15008 389 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ZPBP2Q6X784 338 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 SV2AQ7L0J3 742 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 CCDC113Q9H0I3 377 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD18DP-201ENST00000335478 ADGRA2Q96PE1 1338 aa19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms