RNA–Protein interactions for RNA: YDL135C

RDI1, Transcript of Rho GDP dissociation inhibitor, yeast

Gene RDI1, Length 609 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RDI1	YDL135C	CTM1	P38818	585 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RDI1	YDL135C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RDI1	YDL135C	YGR266W	P53326	701 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RDI1	YDL135C	SED5	Q01590	340 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RDI1	YDL135C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RDI1	YDL135C	ERV41	Q04651	352 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RDI1	YDL135C	FUS2	Q05670	677 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RDI1	YDL135C	PIN3	Q06449	215 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RDI1	YDL135C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RDI1	YDL135C	YOL029C	Q08187	201 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RDI1	YDL135C	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RDI1	YDL135C	STE2	D6VTK4	431 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	SNA3	P14359	133 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	MRX3	P38172	270 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	ECM34	P38728	170 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	COX16	P47081	118 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YDR278C	Q05612	105 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	BSC6	Q08280	497 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	APC9	Q12107	265 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YLR422W	Q06409	1932 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	CSM1	P25651	190 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	MID2	P36027	376 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	MCH2	P36032	473 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YKL070W	P36087	169 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	MRPS9	P38120	278 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YPC1	P38298	316 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	EFM1	P38732	585 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YHL026C	P38740	315 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	RTT105	P40063	208 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	HIT1	P46973	164 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	CPR7	P47103	393 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	SDS23	P53172	527 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	INP1	Q03694	420 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	INP2	Q03824	705 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YMR244W	Q04018	355 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	INO2	P26798	304 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YKL187C	P34231	750 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	SLX1	P38324	304 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YMR262W	P38430	313 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YEL075C	P39972	122 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	GTO1	P48239	356 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	MND1	P53102	219 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	FMP48	P53233	369 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YNR066C	P53752	436 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	VTI1	Q04338	217 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	CDC42	P19073	191 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	AVT2	P39981	480 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	RRG9	P40156	214 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	GDS1	P41913	522 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YFL012W	P43580	148 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	UBC13	P52490	153 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YNL260C	P53846	198 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YLR446W	Q06204	433 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	BCP1	Q06338	283 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	EMP46	Q12396	444 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	IZH4	Q99393	312 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	CSG2	P35206	410 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YBR062C	P38239	180 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	HIS2	P38635	335 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	SWC4	P53201	476 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	FMP16	Q12497	93 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.03	□□□□□ -1.92	not detected
RDI1	YDL135C	ATP6	P00854	259 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	RIB7	P33312	244 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	ZRT3	P34240	503 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YER184C	P39961	794 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YER189W	P40104	122 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	AGP3	P43548	558 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YGR067C	P53243	804 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	ECM11	Q04110	302 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	GMC1	Q04399	608 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	TAZ1	Q06510	381 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	ASR1	Q06834	288 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YOR292C	Q08743	309 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RDI1	YDL135C	CCH1	P50077	2039 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RDI1	YDL135C	HAP2	P06774	265 aa		3.02	□□□□□ -1.93

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 92 ms