RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550078.2

ZBED6-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 12,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6-202ENST00000550078 PLEKHA8Q96JA3 519 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 PKP3Q9Y446 797 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 USP17L8P0C7I0 530 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 GJB2P29033 226 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 CASP6P55212 293 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 DSG4Q86SJ6 1040 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 CPT1CQ8TCG5 803 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 TBCDQ9BTW9 1192 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 BLZF1Q9H2G9 400 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 TRIM36Q9NQ86 728 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 TBKBP1A7MCY6 615 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 MX1P20591 662 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 MGAT1P26572 445 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 PDX1P52945 283 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 RIN3Q8TB24 985 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 INVSQ9Y283 1065 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 A6NCN8 305 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 CSNK2BP67870 215 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 MYBPC2Q14324 1141 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 SDR42E1Q8WUS8 393 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 AGAP3Q96P47 875 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 RPS6KA6Q9UK32 745 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 PTPRCP08575 1304 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 TBC1D4O60343 1298 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 CPNE6O95741 557 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 BCRP11274 1271 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 KLC3Q6P597 504 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 KRBA2Q6ZNG9 492 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 COL26A1Q96A83 441 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 SGIP1Q9BQI5 828 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 TRIM54Q9BYV2 358 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 V9GYQ6 96 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 PLGP00747 810 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 KCNA2P16389 499 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 BBS9Q3SYG4 887 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 DSELQ8IZU8 1212 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 ARHGAP45Q92619 1136 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 KIF12Q96FN5 646 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 NUP85Q9BW27 656 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 C19orf44Q9H6X5 657 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 PADI4Q9UM07 663 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 BDH1Q02338 343 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 CABP7Q86V35 215 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 KAT2BQ92831 832 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 CDH7Q9ULB5 785 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 MLNP12872 115 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 HNF1BP35680 557 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 MLH1P40692 756 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 BASP1P80723 227 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 MPP5Q8N3R9 675 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 MMGT1Q8N4V1 131 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 KIF18AQ8NI77 898 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 CITED4Q96RK1 184 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 GPR63Q9BZJ6 419 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 PARVGQ9HBI0 331 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 MOCS1Q9NZB8 636 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 NOX1Q9Y5S8 564 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 GUCY1B2O75343 617 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 PDHA1P08559 390 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 NAB2Q15742 525 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 UGP2Q16851 508 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 AVL9Q8NBF6 648 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 STARD7Q9NQZ5 370 aa5.55□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 SERTM1A2A2V5 107 aa5.54□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 MBD3O95983 291 aa5.54□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 P4HBP07237 508 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 NAXEQ8NCW5 288 aa5.54□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 MDM1Q8TC05 714 aa5.54□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.54□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 MARK1Q9P0L2 795 aa5.54□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 HYOU1Q9Y4L1 999 aa5.54□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 USP17L3A6NCW0 530 aa5.54□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 USP17L4A6NCW7 530 aa5.54□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 FSBPO95073 299 aa5.54□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 C10orf120Q5SQS8 335 aa5.54□□□□□ -1.52
ZBED6-202ENST00000550078 USP17L1Q7RTZ2 530 aa5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms