RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429762.7

VSX1-205, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-205ENST00000429762 ZNF233A6NK53 670 aa23.99■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 CCP110O43303 1012 aa23.99■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 SCP2P22307 547 aa23.99■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 MXI1P50539 228 aa23.99■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 TMEM62Q0P6H9 643 aa23.99■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 LMO3Q8TAP4 145 aa23.99■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 TCHPQ9BT92 498 aa23.99■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 LZTFL1Q9NQ48 299 aa23.99■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 ASAP2O43150 1006 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 KIF22Q14807 665 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 TMEM132AQ24JP5 1023 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 SLFN12LQ6IEE8 588 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 SPAG5Q96R06 1193 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 ABL1P00519 1130 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 PGK1P00558 417 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 TMOD1P28289 359 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 TNFSF9P41273 254 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 EPC2Q52LR7 807 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 EEF1DP3Q658K8 133 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 HGSNATQ68CP4 663 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 ZPBP2Q6X784 338 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 EHBP1Q8NDI1 1231 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 NLRP7Q8WX94 980 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 SCLT1Q96NL6 688 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 FZD8Q9H461 694 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 PDE11AQ9HCR9 933 aa23.98■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 CLDN3O15551 220 aa23.97■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 PHKA2P46019 1235 aa23.97■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 ASIC2Q16515 512 aa23.97■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 ARHGEF19Q8IW93 802 aa23.97■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 TMC2Q8TDI7 906 aa23.97■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 SEMA4DQ92854 862 aa23.97■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 DNAJC12Q9UKB3 198 aa23.97■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 Q9Y3F1 56 aa23.97■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 PTPRJQ12913 1337 aa23.97■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 ABLIM1O14639 778 aa23.96■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 TOM1L1O75674 476 aa23.96■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 CDK17Q00537 523 aa23.96■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 CYP27A1Q02318 531 aa23.96■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa23.96■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 MAP7D2Q96T17 732 aa23.96■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 ACKR2O00590 384 aa23.96■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 ATF7IP2Q5U623 682 aa23.96■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 ZNF516Q92618 1163 aa23.96■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 CCDC42Q96M95 316 aa23.96■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
VSX1-205ENST00000429762 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.95■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 HAS3O00219 553 aa23.95■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 FGFR4P22455 802 aa23.95■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 GPC3P51654 580 aa23.95■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 JAM2P57087 298 aa23.95■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 PSMD6Q15008 389 aa23.95■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.95■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 CPB2Q96IY4 423 aa23.95■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 DEF6Q9H4E7 631 aa23.95■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 KIAA1586Q9HCI6 787 aa23.95■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 TRIM10Q9UDY6 481 aa23.95■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 GINS2Q9Y248 185 aa23.95■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 ZNF263O14978 683 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 KIF11P52732 1056 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 PURAQ00577 322 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 ARHGAP44Q17R89 818 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 KIZQ2M2Z5 673 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 TAS1R2Q8TE23 839 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 TMEM8AQ9HCN3 771 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 APEX2Q9UBZ4 518 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 NRCAMQ92823 1304 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 FAM189A1O60320 539 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 CYP2C9P11712 490 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 OSTNP61366 133 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 ZNF568Q3ZCX4 644 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 GNASQ5JWF2 1037 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 KRT39Q6A163 491 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 SV2AQ7L0J3 742 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 CCDC170Q8IYT3 715 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 KAT5Q92993 513 aa23.94■■□□□ 1.42
VSX1-205ENST00000429762 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.8 ms