RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD40Q6AI12 368 aa32.3■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 SLFN12LQ6IEE8 588 aa32.3■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA5Q8TBA6 731 aa32.3■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 POMGNT1Q8WZA1 660 aa32.3■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 CBWD1Q9BRT8 395 aa32.3■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 CALUO43852 315 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC173Q0VFZ6 552 aa32.29■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 UBXN11Q5T124 520 aa32.29■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 ARMCX5Q6P1M9 558 aa32.29■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 LINC01599Q8WXQ3 324 aa32.29■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 CDT1Q9H211 546 aa32.29■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 MICAL3Q7RTP6 2002 aa32.29■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 NPTXRO95502 500 aa32.29■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 HARSP12081 509 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 MCL1Q07820 350 aa32.29■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP32.29■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 SARM1Q6SZW1 724 aa32.29■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 TSG101Q99816 390 aa32.29■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 PCIF1Q9H4Z3 704 aa32.29■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 RWDD2AQ9UIY3 292 aa32.29■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0B4J269 797 aa32.28■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 BICDL2A1A5D9 508 aa32.28■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 GARTP22102 1010 aa32.28■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC63Q05C16 580 aa32.28■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 C16orf59Q7L2K0 433 aa32.28■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 PDLIM2Q96JY6 352 aa32.28■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R9BQ96SB3 815 aa32.28■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 MSTO1Q9BUK6 570 aa32.28■■■□□ 2.76
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ECHS1-201ENST00000368547 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 RGS18Q9NS28 235 aa32.28■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
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ECHS1-201ENST00000368547 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa32.27■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 TTI2Q6NXR4 508 aa32.27■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 MED15Q96RN5 788 aa32.27■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 NR3C1P04150 777 aa32.26■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 MCF2P10911 925 aa32.26■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 EPHB4P54760 987 aa32.26■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 EDRF1Q3B7T1 1238 aa32.26■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 C12orf56Q8IXR9 622 aa32.26■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 TRAIPQ9BWF2 469 aa32.26■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 FAM105AQ9NUU6 356 aa32.26■■■□□ 2.76
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ECHS1-201ENST00000368547 HSPBP1Q9NZL4 362 aa32.26■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 ENPP3O14638 875 aa32.25■■■□□ 2.75
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ECHS1-201ENST00000368547 NR2F2P24468 414 aa32.24■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 NFIL3Q16649 462 aa32.24■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 SLC24A5Q71RS6 500 aa32.24■■■□□ 2.75
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ECHS1-201ENST00000368547 CEP120Q8N960 986 aa32.24■■■□□ 2.75
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ECHS1-201ENST00000368547 SAAL1Q96ER3 474 aa32.24■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0U1RQF3 1178 aa32.23■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 C9IYK1 514 aa32.23■■■□□ 2.75
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ECHS1-201ENST00000368547 ACTN1P12814 892 aa32.23■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 SEZ6Q53EL9 994 aa32.23■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 SPATA1Q5VX52 437 aa32.23■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 FOXR2Q6PJQ5 311 aa32.23■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF365Q70YC5 407 aa32.23■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 SLC9A9Q8IVB4 645 aa32.23■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
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ECHS1-201ENST00000368547 C1orf112Q9NSG2 853 aa32.23■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 DMAC2Q9NW81 257 aa32.23■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 HES2Q9Y543 173 aa32.23■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 IPPQ9Y573 584 aa32.23■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa32.22■■■□□ 2.75
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ECHS1-201ENST00000368547 AP5Z1O43299 807 aa32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 FAM189A1O60320 539 aa32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 FGBP02675 491 aa32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 RPL13P26373 211 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 RAB27AP51159 221 aa32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 OSTNP61366 133 aa32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 ADAM9Q13443 819 aa32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 OTOP2Q7RTS6 562 aa32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM174Q8WUU8 243 aa32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 HSD3B7Q9H2F3 369 aa32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA8IPA6NC78 632 aa32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA8JA6NMD2 632 aa32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 ADCY5O95622 1261 aa32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 XXYLT1Q8NBI6 393 aa32.22■■■□□ 2.75
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