RNA–Protein interactions for RNA: YNL296W

YNL296W, Transcript of Dubious open reading frame unlikely to encode a functional protein, yeast

Gene YNL296W, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL296W	YNL296W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	DGR2	P32330	852 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	ECM15	P35195	104 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	YHR035W	P38769	630 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	SWD1	P39706	426 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	YER184C	P39961	794 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	FLX1	P40464	311 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	IRC5	P43610	853 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	YGL235W	P53071	178 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	MRM2	P53123	320 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	YNR062C	P53748	327 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	GEP3	Q08622	556 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	MRX4	Q12467	430 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL296W	YNL296W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	NIC96	P34077	839 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	YBR241C	P38142	488 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	CCZ1	P38273	704 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	PEX7	P39108	375 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	IDS2	P46958	469 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	YDC1	Q02896	317 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	MSS11	Q03825	758 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	MFG1	Q07684	458 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	RRT8	Q08219	342 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	NUF2	P33895	451 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	YNL181W	P53878	407 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	SNO4	Q04902	237 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	SPR28	Q04921	423 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	VPS36	Q06696	566 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	PSR1	Q07800	427 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	HRT1	Q08273	121 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	HSP32	Q08992	237 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	LAS17	Q12446	633 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
YNL296W	YNL296W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	SAM35	P14693	329 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	CCA1	P21269	546 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	PRP28	P23394	588 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	VPH2	P32341	215 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
YNL296W	YNL296W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	PTC7	P38797	343 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	SLM1	P40485	686 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	COG2	P53271	262 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	BNA7	Q04066	261 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	GPI17	Q04080	534 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	TMA10	Q06177	86 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	ARO10	Q06408	635 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	ARR2	Q06597	130 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	RRI1	Q12468	440 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	CMK2	P22517	447 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	PPA2	P28239	310 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	BAP2	P38084	609 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	PEX32	P38292	413 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	RCY1	P39531	840 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	YEL068C	P39977	110 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	GNP1	P48813	663 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	HNT2	P49775	206 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	WSC2	P53832	503 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	FAR8	Q05040	523 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	EXO70	P19658	623 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	BOS1	P25385	244 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	PEX6	P33760	1030 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	CUE1	P38428	203 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	MLH1	P38920	769 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	SPO73	P40031	143 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	NAS2	P40555	220 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	LOH1	P47055	219 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	TYW3	P53177	273 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL296W	YNL296W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.9 ms