RNA–Protein interactions for RNA: YLR431C

ATG23, Transcript of Peripheral membrane protein required for autophagy and CVT, yeast

Gene ATG23, Length 1,362 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG23	YLR431C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	LDB7	P38210	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	YJR012C	P47087	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	TLG1	Q03322	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	INP2	Q03824	705 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	YOS9	Q99220	542 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	DAL81	P21657	970 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	RMI1	Q02685	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	YDR209C	Q03480	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	GTO3	Q04806	366 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	SEC10	Q06245	871 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	MMT2	Q08970	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG23	YLR431C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	GPX1	P36014	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	YBR062C	P38239	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	SNM1	P40993	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	HIT1	P46973	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	MAL13	P53338	473 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
ATG23	YLR431C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	MRX11	Q03079	207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	ARG80	P07249	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	GPI18	P38211	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	YPS5	P53057	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	SRO7	Q12038	1033 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	PEX3	P28795	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	GGC1	P38988	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	VPS60	Q03390	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	RPO26	P20435	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	PPA2	P28239	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	QRI5	P32344	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	TIP20	P33891	701 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	MBA1	P38300	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	YER184C	P39961	794 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	DSN1	P40568	576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	GLG2	P47011	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	COG7	P53195	279 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	SPO77	Q06134	477 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	SNF8	Q12483	233 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	JIP3	O13555	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	ATG12	P38316	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	HOC1	P47124	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	GIS3	Q12418	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	PBN1	P25580	416 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	VPH2	P32341	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	MRP21	P38175	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	SIP3	P38717	1229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	SWS2	P53937	143 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	VHS1	Q03785	461 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	MHR1	Q06630	226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	YDR018C	Q12185	396 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	STH1	P32597	1359 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	COX4	P04037	155 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	FRM2	P37261	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	YFL064C	P43540	174 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	RPC17	P47076	161 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	NBP35	P52920	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	FMP48	P53233	369 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	API2	Q04413	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG23	YLR431C	COQ1	P18900	473 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	MRPL3	P36516	390 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	KRE29	P40026	464 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	SER33	P40510	469 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	VEL1	P53058	206 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	LIF1	P53150	421 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	BNA7	Q04066	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	TRM10	Q12400	293 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	NCB2	Q92317	146 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	SAC3	P46674	1301 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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