RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493711.1

SNX17-208, Transcript of sorting nexin 17, human

TSL 3

Gene SNX17, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX17-208	ENST00000493711	GDA	Q9Y2T3	454 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	N4BP3	O15049	544 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	TOM1L1	O75674	476 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	PFKM	P08237	780 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	BMP6	P22004	513 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	CCNE1	P24864	410 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	CASP5	P51878	434 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF445	P59923	1031 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	PAK1	Q13153	545 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	MYBPC2	Q14324	1141 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	LPIN1	Q14693	890 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	KYAT1	Q16773	422 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	ISM2	Q6H9L7	571 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	SEPT8	Q92599	483 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	TSPAN1	O60635	241 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	CXCL10	P02778	98 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	GHR	P10912	638 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	GART	P22102	1010 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	NFIL3	Q16649	462 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	AMHR2	Q16671	573 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	CENPP	Q6IPU0	288 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	P2RX5	Q93086	422 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711		A0A1B0GUA9	196 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	CLDN3	O15551	220 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	MCF2	P10911	925 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	SKI	P12755	728 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	CYP2C18	P33260	490 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	FAM228A	Q86W67	206 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	NELFB	Q8WX92	580 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	DPF3	Q92784	378 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	TCHP	Q9BT92	498 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	TSPY26P	Q9H489	355 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	PADI3	Q9ULW8	664 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	SMTNL1	A8MU46	457 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	EFCAB14	O75071	495 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	CD52	P31358	61 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	HOXD13	P35453	343 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	RAB27A	P51159	221 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	CCL23	P55773	120 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNX17-208	ENST00000493711	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23

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