RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ephb3P54754 993 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pstpip1P97814 415 aa23.89■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gbp1Q01514 589 aa23.89■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smyd5Q3TYX3 416 aa23.89■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Oog4Q4G0C7 502 aa23.89■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf354cQ571J5 560 aa23.89■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kctd12bQ8C7J6 292 aa23.89■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam160b1Q8CDM8 764 aa23.89■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Matr3Q8K310 846 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pex11aQ9Z211 246 aa23.89■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Plxna1P70206 1894 aa23.89■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyp4a29A0A087WPC3 509 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igkv10-96A0A140T8M1 115 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm13084A2A8N0 494 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Clca3bE9PUL3 1044 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Casp14O89094 257 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mmp3P28862 477 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Oas1fQ14AZ4 364 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Git1Q68FF6 770 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smarca1Q6PGB8 1046 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 GmipQ6PGG2 971 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TbataQ7TSD4 393 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Daam2Q80U19 1115 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp120Q8BZW4 436 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tceal5Q8CCT4 200 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Foxe1Q8R2I0 371 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 VillQ91YD6 859 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smyd3Q9CWR2 428 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olig1Q9JKN5 260 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Piezo2Q8CD54 2822 aa23.88■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm21973F6WEZ7 68 aa23.87■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ogfod1Q3U0K8 545 aa23.87■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wdr18Q4VBE8 431 aa23.87■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Colgalt2Q6NVG7 625 aa23.87■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kcnv1Q8BZN2 503 aa23.87■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem161bQ8C2L6 487 aa23.87■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp623Q9CY99 499 aa23.87■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gyg1Q9R062 333 aa23.87■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lcmt1A0A0U1RNF2 332 aa23.86■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ect2lA0A140LIP2 953 aa23.86■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam209A2APA5 170 aa23.86■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Resp18P47939 175 aa23.86■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Defa-rs12P50716 91 aa23.86■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dlg3P70175 849 aa23.86■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trim43cP86449 446 aa23.86■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sox9Q04887 507 aa23.86■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ap5z1Q3U829 807 aa23.86■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cd37Q61470 281 aa23.86■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyp3a11Q64459 504 aa23.86■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tcaf1Q8BNE1 924 aa23.86■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zmym6Q8BS54 1249 aa23.86■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Setdb2Q8C267 713 aa23.86■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa23.86■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mmrn2A6H6E2 943 aa23.85■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adcy7P51829 1099 aa23.85■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zbtb8osQ505B7 168 aa23.85■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 E2f7Q6S7F2 904 aa23.85■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Jade2Q6ZQF7 829 aa23.85■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Clec1aQ8BWY2 269 aa23.85■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tdrd7Q8K1H1 1086 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trim54Q9ERP3 366 aa23.85■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dnah12Q3V0Q1 3086 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Map7d2A2AG50 781 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyp2b23E9Q593 491 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 G430095P16RikE9Q913 147 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nptx2O70340 429 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PargO88622 969 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 LxnP70202 222 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc85bQ6PDY0 202 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Snx13Q6PHS6 957 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ano5Q75UR0 904 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dzip3Q7TPV2 1204 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TbckQ8BM85 762 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NelfbQ8C4Y3 580 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 B3galt6Q91Z92 325 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tab2Q99K90 693 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp64Q99KE8 643 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pramef12Q9D2F1 463 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1700016D06RikQ9DAA5 166 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tlr6Q9EPW9 795 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 B4galt5Q9JMK0 388 aa23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Add1Q9QYC0 735 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igkv18-36A0A075B5M9 114 aa23.83■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam129cD3YZB0 591 aa23.83■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm5624F6ZZG8 207 aa23.83■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pak1O88643 545 aa23.83■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pde6bP23440 856 aa23.83■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Irf8P23611 424 aa23.83■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arf4P61750 180 aa23.83■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SnrpfP62307 86 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sparcl1P70663 650 aa23.83■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gse1Q3U3C9 1213 aa23.83■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc26a2Q62273 739 aa23.83■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Npas4Q8BGD7 802 aa23.83■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcdha12Q91Y18 950 aa23.83■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Col25a1Q99MQ5 666 aa23.83■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kif17Q99PW8 1038 aa23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 63.9 ms