RNA–Protein interactions for RNA: YHL028W

WSC4, Transcript of Endoplasmic reticulum (ER) membrane protein, yeast

Gene WSC4, Length 1,818 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WSC4	YHL028W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	SAC7	P17121	654 aa		7.12	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	AAC3	P18238	307 aa		7.12	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	YCL002C	P25565	263 aa		7.12	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	MDL1	P33310	695 aa		7.12	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	WSC4	P38739	605 aa		7.12	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	YHR122W	P38829	231 aa		7.12	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	NSG1	P38837	291 aa		7.12	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	GPG1	P53130	126 aa		7.12	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	MTL1	P53214	551 aa		7.12	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	SSY1	Q03770	852 aa		7.12	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	VBA1	Q04301	562 aa		7.12	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	HLR1	Q04429	423 aa		7.12	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	YLR108C	Q12259	485 aa		7.12	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		7.12	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	SSH4	P32343	579 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.11	□□□□□ -1.27	not detected
WSC4	YHL028W	SRY1	P36007	326 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	DTR1	P38125	572 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	THI2	P38141	450 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	ANS1	P38832	159 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	AIM46	P38885	310 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	POP1	P41812	875 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	IBA57	P47158	497 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	RSM28	Q03430	361 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	YDL177C	Q12257	170 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	RDI1	Q12434	202 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	GAL4	P04386	881 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	CDC9	P04819	755 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	ARG80	P07249	177 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	CDC23	P16522	626 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	PTP1	P25044	335 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	COQ2	P32378	372 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	ECM15	P35195	104 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	SRX1	P36077	127 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	PAU24	P38155	120 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	COS8	P38723	381 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	SDP1	P40479	209 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	PMT5	P52867	743 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	SNX41	Q04053	625 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	RRN11	Q04712	507 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	GUP2	Q08929	609 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	YRM1	Q12340	786 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		7.11	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	QCR7	P00128	127 aa		7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	YMC1	P32331	307 aa		7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	SRB6	P32570	121 aa		7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	MRPL36	P36531	177 aa		7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	LAG1	P38703	411 aa		7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	TRR2	P38816	342 aa		7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	ELO1	P39540	310 aa		7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	SMK1	P41808	388 aa		7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	YGL101W	P53144	215 aa		7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	PAU12	P53343	120 aa		7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	YNR062C	P53748	327 aa		7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	DCR2	Q05924	578 aa		7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	HAP4	P14064	554 aa		7.09	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	BOS1	P25385	244 aa		7.09	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	YCR061W	P25639	631 aa		7.09	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	YOR062C	P36025	268 aa		7.09	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.09	□□□□□ -1.27	not detected
WSC4	YHL028W	HIS6	P40545	261 aa		7.09	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	DOC1	P53068	250 aa		7.09	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	SWS2	P53937	143 aa		7.09	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	TAZ1	Q06510	381 aa		7.09	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	CYK3	Q07533	885 aa		7.09	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	GLO4	Q12320	285 aa		7.09	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	YDR262W	Q12331	272 aa		7.09	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	NPC2	Q12408	173 aa		7.09	□□□□□ -1.27
WSC4	YHL028W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
WSC4	YHL028W	SOD2	P00447	233 aa		7.08	□□□□□ -1.28
WSC4	YHL028W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
WSC4	YHL028W	ERG4	P25340	473 aa		7.08	□□□□□ -1.28
WSC4	YHL028W	MXR2	P25566	168 aa		7.08	□□□□□ -1.28
WSC4	YHL028W	DOA4	P32571	926 aa		7.08	□□□□□ -1.28
WSC4	YHL028W	ISC10	P32645	267 aa		7.08	□□□□□ -1.28
WSC4	YHL028W	VPS51	P36116	164 aa		7.08	□□□□□ -1.28
WSC4	YHL028W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28

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