RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	STE7	P06784	515 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YAK1	P14680	807 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	NUP2	P32499	720 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YBR144C	P34215	104 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	SKG1	P36169	355 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	MED8	P38304	223 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	RCK1	P38622	512 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YHR210C	P38893	341 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YGR016W	P53209	190 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	NRM1	P53718	249 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	SED5	Q01590	340 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	APC4	Q04601	652 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YLR456W	Q06199	204 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	MFG1	Q07684	458 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	COS7	Q07788	383 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YLR030W	Q07967	263 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	YLR036C	Q07986	203 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX1	YBR228W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.78	□□□□□ -1.8	not detected
SLX1	YBR228W	COR1	P07256	457 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	PEX3	P28795	441 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.77	□□□□□ -1.81	not detected
SLX1	YBR228W	AST1	P35183	429 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	DOA1	P36037	715 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	AIM2	P39721	246 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	YIL067C	P40514	678 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	YIL001W	P40560	513 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.77	□□□□□ -1.81	RIP-Chip
SLX1	YBR228W	YFL067W	P43537	175 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	FMP33	P46998	180 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	GWT1	P47026	490 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	HOC1	P47124	396 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	IBA57	P47158	497 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	LCL3	P53153	274 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	YNL095C	P53932	642 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	YKU80	Q04437	629 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	ARR1	Q06596	294 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	GPI11	Q06636	219 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	RAD7	P06779	565 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	GAL3	P13045	520 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	CMK2	P22517	447 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	YBR241C	P38142	488 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	YHR177W	P38867	453 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	FAU1	P40099	211 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	PAC10	P48363	199 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	YNR068C	P53754	272 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	DSL1	P53847	754 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	IGO1	P53897	168 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	SPR6	Q01684	191 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	OAZ1	Q02803	292 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	HOT1	Q03213	719 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	PEX12	Q04370	399 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	THP1	Q08231	455 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	YOR365C	Q08844	703 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	YDR061W	Q12298	539 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	PSY3	Q12318	242 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	MER1	P16523	270 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	POL4	P25615	582 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	NTG1	P31378	399 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	MKK1	P32490	508 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	MSN2	P33748	704 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	TAF14	P35189	244 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	MRPL15	P36523	253 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	RIB1	P38066	345 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	RBG1	P39729	369 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	YIL086C	P40503	102 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	STE24	P47154	453 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	TOM22	P49334	152 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	RMR1	P53060	241 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	CDH1	P53197	566 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	YSA1	Q01976	231 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	PBA1	Q05778	276 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.75	□□□□□ -1.81	not detected
SLX1	YBR228W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	YDL199C	Q12407	687 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	MHF2	Q3E829	80 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	TIM9	O74700	87 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SLX1	YBR228W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81

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