RNA–Protein interactions for RNA: YAL067C

SEO1, Transcript of Putative permease, yeast

Gene SEO1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEO1	YAL067C	DFG10	P40526	253 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	YIA6	P40556	373 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	MAL13	P53338	473 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	CTR3	Q06686	241 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	FRE8	Q12209	686 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	SPS100	P13130	326 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	QRI5	P32344	111 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	PDC2	P32896	925 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	SPO23	P33757	523 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	YIL001W	P40560	513 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	MRM2	P53123	320 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	ORM2	Q06144	216 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	SFH1	Q06168	426 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	PLB3	Q08108	686 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	TMS1	Q12116	473 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	SIN3	P22579	1536 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	SSN2	P38931	1420 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	MDM10	P18409	493 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	EHD3	P28817	500 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	AGA1	P32323	725 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	SCO2	P38072	301 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	SDS24	P38314	527 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	ATG12	P38316	186 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	MTC6	P38849	526 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	ALG8	P40351	577 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	YNL320W	P42840	284 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	YJR012C	P47087	207 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	NIF3	P53081	288 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	GET1	P53192	235 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	YNL095C	P53932	642 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	TDA1	Q03533	586 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	COX14	P39103	70 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	COX15	P40086	486 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	PEX31	P53203	462 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	SUR7	P54003	302 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	TLG2	Q08144	397 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	TAF10	Q12030	206 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SEO1	YAL067C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	MRS3	P10566	314 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	NAM9	P27929	486 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.76	not detected
SEO1	YAL067C	YBR096W	P38256	230 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	IKI1	P38874	309 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	MTW1	P39731	289 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	IBA57	P47158	497 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	MGA1	P53050	456 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	TPN1	P53099	579 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	CTF19	Q02732	369 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	MHR1	Q06630	226 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	MFG1	Q07684	458 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YCT1	Q12235	531 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	PCL9	Q12477	304 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	PRM4	Q12498	284 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	ESP1	Q03018	1630 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	SCC2	Q04002	1493 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	FUN26	P31381	517 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	SSO1	P32867	290 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	PMU1	P36069	295 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	LCB3	P47013	409 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	USE1	P53146	245 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YMR166C	Q03829	368 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YLR446W	Q06204	433 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YDL109C	Q12103	647 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	MMS1	Q06211	1407 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	HEM4	P06174	275 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	CYC3	P06182	269 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	ATS1	P31386	333 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	VPS51	P36116	164 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	PET8	P38921	284 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SEO1	YAL067C	MET30	P39014	640 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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