RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
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RP9-201ENST00000297157 RSPH1Q8WYR4 309 aa28.44■■■□□ 2.14
RP9-201ENST00000297157 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
RP9-201ENST00000297157 CHST12Q9NRB3 414 aa28.44■■■□□ 2.14
RP9-201ENST00000297157 GAS2O43903 313 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
RP9-201ENST00000297157 MUTP22033 750 aa28.43■■■□□ 2.14
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RP9-201ENST00000297157 MRE11P49959 708 aa28.43■■■□□ 2.14
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RP9-201ENST00000297157 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa28.42■■■□□ 2.14
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RP9-201ENST00000297157 APOL5Q9BWW9 433 aa28.38■■■□□ 2.13
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RP9-201ENST00000297157 TCP11Q8WWU5 503 aa28.36■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
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RP9-201ENST00000297157 MTRQ99707 1265 aa28.35■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 PRRX2Q99811 253 aa28.35■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 TBC1D13Q9NVG8 400 aa28.35■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 USP34Q70CQ2 3546 aa28.35■■■□□ 2.13
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