RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Taf4bG5E8Z2 855 aa23.95■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn2r53L7N473 806 aa23.95■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smpd2O70572 419 aa23.95■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gfpt1P47856 697 aa23.95■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Carmil2Q3V3V9 1296 aa23.95■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ChpfQ6IQX7 774 aa23.95■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Polr3gQ6NXY9 223 aa23.95■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fut11Q8BHC9 489 aa23.95■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lrrc41Q8K1C9 807 aa23.95■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 BrdtQ91Y44 956 aa23.95■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc96Q9CR92 584 aa23.95■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa23.95■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Baz2aQ91YE5 1889 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gucy2dA0A0U1RPR8 1117 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc16a6B1AT66 607 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Syce3B5KM66 88 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc152E9PX14 254 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rgs2O08849 211 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 P01734 135 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccnd2P30280 289 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gtf2bP62915 316 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pnpla5Q32LZ8 432 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tgfbrap1Q3UR70 860 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mfhas1Q3V1N1 1048 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Uimc1Q5U5Q9 727 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ctnna3Q65CL1 895 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ribc1Q9D0B8 379 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Efhd1Q9D4J1 240 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Serpinb12Q9D7P9 423 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atp13a1Q9EPE9 1200 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rab27aQ9ERI2 221 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tex21Q9R0U9 575 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cep350E9Q309 3095 aa23.94■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cep290Q6A078 2472 aa23.93■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ttll8A4Q9F1 832 aa23.93■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eif3dO70194 548 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tnfaip1O70479 316 aa23.93■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bmpr1aP36895 532 aa23.93■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Serpina1eQ00898 413 aa23.93■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nat8lQ3UGX3 299 aa23.93■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam198aQ3UY90 562 aa23.93■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MymkQ9D1N4 221 aa23.93■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mss51Q9D5Z5 446 aa23.93■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sept3Q9Z1S5 350 aa23.93■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Xpnpep3B7ZMP1 506 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn2r87E9PZX4 848 aa23.92■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dcpp3L7N259 170 aa23.92■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kcnn2P58390 839 aa23.92■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Asprv1Q09PK2 339 aa23.92■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mbtd1Q6P5G3 631 aa23.92■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 March6Q6ZQ89 909 aa23.92■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa23.92■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gprc5aQ8BHL4 356 aa23.92■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf467Q8JZL0 594 aa23.92■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prpf6Q91YR7 941 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tor1aip1Q921T2 595 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Med15Q924H2 789 aa23.92■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Htatip2Q9Z2G9 242 aa23.92■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Col6a3E9PWQ3 3284 aa23.92■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Jbts17Q8CE72 3214 aa23.91■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ddx23D3Z0M9 819 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Serpinb3aG3X9V8 387 aa23.91■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 EomesO54839 707 aa23.91■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ca3P16015 260 aa23.91■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mcm4P49717 862 aa23.91■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Stim1P70302 685 aa23.91■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Klra7Q60654 280 aa23.91■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Suz12Q80U70 741 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 6820408C15RikQ8BJX2 354 aa23.91■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Colgalt1Q8K297 617 aa23.91■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sbk1Q8QZX0 417 aa23.91■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rhobtb3Q9CTN4 611 aa23.91■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PigoQ9JJI6 1093 aa23.91■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dnajb7Q9QYI8 312 aa23.91■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Oaz3Q9R109 243 aa23.91■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Col4a4Q9QZR9 1682 aa23.91■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm4307E9PZY4 289 aa23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm4312K9J7E2 289 aa23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kng1O08677 661 aa23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Stx1aO35526 288 aa23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 EnamO55196 1274 aa23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cxcl12P40224 93 aa23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tyro3P55144 880 aa23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcbp1P60335 356 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PrkcbP68404 671 aa23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ano7Q14AT5 859 aa23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hexim2Q3TVI4 313 aa23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Asap3Q5U464 904 aa23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cd180Q62192 661 aa23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kdm1aQ6ZQ88 853 aa23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Susd6Q8BGE4 302 aa23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usp37Q8C0R0 979 aa23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Luzp1Q8R4U7 1068 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ears2Q9CXJ1 523 aa23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Myo15bI7HPW8 3033 aa23.9■■□□□ 1.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Klhdc7aA2APT9 773 aa23.89■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Akr1b1P45376 316 aa23.89■■□□□ 1.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mcm5P49718 733 aa23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65.3 ms