Protein–RNA interactions for Protein: A2APT9

Klhdc7a, Kelch domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc7aA2APT9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
Klhdc7aA2APT9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Klhdc7aA2APT9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Klhdc7aA2APT9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Klhdc7aA2APT9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Klhdc7aA2APT9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Klhdc7aA2APT9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Klhdc7aA2APT9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Klhdc7aA2APT9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Klhdc7aA2APT9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Klhdc7aA2APT9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Klhdc7aA2APT9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Klhdc7aA2APT9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Klhdc7aA2APT9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Klhdc7aA2APT9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Klhdc7aA2APT9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Klhdc7aA2APT9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Klhdc7aA2APT9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Klhdc7aA2APT9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Klhdc7aA2APT9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Klhdc7aA2APT9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Klhdc7aA2APT9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Klhdc7aA2APT9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Klhdc7aA2APT9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Klhdc7aA2APT9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Klhdc7aA2APT9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Klhdc7aA2APT9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Klhdc7aA2APT9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Klhdc7aA2APT9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Klhdc7aA2APT9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Klhdc7aA2APT9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Klhdc7aA2APT9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Klhdc7aA2APT9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Klhdc7aA2APT9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Klhdc7aA2APT9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Klhdc7aA2APT9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Klhdc7aA2APT9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Klhdc7aA2APT9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Klhdc7aA2APT9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Klhdc7aA2APT9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Klhdc7aA2APT9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Klhdc7aA2APT9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Klhdc7aA2APT9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Klhdc7aA2APT9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Klhdc7aA2APT9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Klhdc7aA2APT9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Klhdc7aA2APT9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Klhdc7aA2APT9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Klhdc7aA2APT9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Klhdc7aA2APT9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Klhdc7aA2APT9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Klhdc7aA2APT9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Klhdc7aA2APT9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Klhdc7aA2APT9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.89■■■□□ 2.69
Klhdc7aA2APT9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Klhdc7aA2APT9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Klhdc7aA2APT9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Klhdc7aA2APT9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Klhdc7aA2APT9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Klhdc7aA2APT9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Klhdc7aA2APT9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Klhdc7aA2APT9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Klhdc7aA2APT9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Klhdc7aA2APT9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Klhdc7aA2APT9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Klhdc7aA2APT9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Klhdc7aA2APT9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Klhdc7aA2APT9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Klhdc7aA2APT9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Klhdc7aA2APT9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Klhdc7aA2APT9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Klhdc7aA2APT9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Klhdc7aA2APT9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Klhdc7aA2APT9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Klhdc7aA2APT9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Klhdc7aA2APT9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Klhdc7aA2APT9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Klhdc7aA2APT9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Klhdc7aA2APT9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Klhdc7aA2APT9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Klhdc7aA2APT9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Klhdc7aA2APT9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Klhdc7aA2APT9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Klhdc7aA2APT9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Klhdc7aA2APT9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Klhdc7aA2APT9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Klhdc7aA2APT9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Klhdc7aA2APT9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Klhdc7aA2APT9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Klhdc7aA2APT9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Klhdc7aA2APT9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Klhdc7aA2APT9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Klhdc7aA2APT9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Klhdc7aA2APT9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Klhdc7aA2APT9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Klhdc7aA2APT9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Klhdc7aA2APT9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Klhdc7aA2APT9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Klhdc7aA2APT9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Klhdc7aA2APT9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms