RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021424.4

Sptlc2-201, Transcript of Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sptlc2, Length 6,710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ephb4P54761 987 aa16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm13103Q4VAD2 491 aa16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 NgrnQ99KS2 293 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm7356A0A087WSA6 508 aa16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cdh18E9Q9Q6 790 aa16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Eps15l1Q60902 907 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Syf2Q9D198 242 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Q9D937 123 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cpb2Q9JHH6 422 aa16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ercc4Q9QZD4 917 aa16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Flt1P35969 1333 aa16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tcp11x2A2AEI7 503 aa16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 MafgO54790 162 aa16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Dync1i2O88487 612 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ogfod1Q3U0K8 545 aa16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Glis3Q6XP49 780 aa16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 PolrmtQ8BKF1 1207 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rps6ka5Q8C050 863 aa16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Slc30a5Q8R4H9 761 aa16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 StrbpQ91WM1 672 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Nsmce3Q9CPR8 279 aa16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 1700129C05RikQ9CQ77 218 aa16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Mphosph6Q9D1Q1 161 aa16.24■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Phldb3E9QAF4 648 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Kcnh2O35219 1162 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Fhod1Q6P9Q4 1197 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Sept8Q8CHH9 429 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Nme9A0A1L1SUL6 329 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 L3mbtl1A2A5N8 826 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Vmn2r79E9Q067 851 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cyp3a25O09158 503 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Akap4Q60662 849 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr698Q7TRN4 311 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pum3Q8BKS9 647 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Vps39Q8R5L3 886 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gpsm2Q8VDU0 679 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gpr108Q91WD0 569 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Abtb1Q99LJ2 478 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ndufaf7Q9CWG8 436 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Scnn1bQ9WU38 638 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Vstm4T1NXB5 319 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 CnpP16330 420 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cyp2c39P56656 490 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tatdn3Q3U1C6 294 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Vav2Q60992 868 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Vps37aQ8CHS8 397 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Champ1Q8K327 802 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Dnajc28Q8VCE1 385 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Serpina3nQ91WP6 418 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rnf31Q924T7 1066 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 2310003L06RikQ9CV82 495 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 E230025N22RikG5E8S3 482 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cd19P25918 547 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pdha1P35486 390 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 EgfrQ01279 1210 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 CpQ61147 1061 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 ChiaQ91XA9 473 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Arl2bpQ9D385 163 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Capn15Q9JLG8 1095 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Trim72Q1XH17 477 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 9130409I23RikQ3TS87 320 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Trim47Q8C0E3 641 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ifi35Q9D8C4 286 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Asah2Q9JHE3 756 aa16.23■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ifnb1P01575 182 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 D1Pas1P16381 660 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cst8P32766 142 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 BC051142Q3V0M8 400 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Adamts18Q4VC17 1219 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Sema4dO09126 861 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pcgf5Q3UK78 256 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm5622Q810Q0 167 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tlk1Q8C0V0 766 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Snap47Q8R570 413 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Klc4Q9DBS5 619 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cyp39a1Q9JKJ9 470 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm10639E9Q6L7 222 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gsta2P10648 222 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Casc4Q6P2L7 435 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pabpc4Q6PHQ9 660 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Disc1Q811T9 852 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Fam161bQ8CB59 589 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cse1lQ9ERK4 971 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cul1Q9WTX6 776 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 KitP05532 979 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Lzts1P60853 599 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pick1Q62083 416 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Zfp418Q8BFS8 652 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Nup93Q8BJ71 819 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Upb1Q8VC97 393 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Nmrk1Q91W63 195 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 ArpinQ9D0A3 226 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 DtnaQ9D2N4 746 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Snx5Q9D8U8 404 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Nr1h3Q9Z0Y9 445 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Abcb11Q9QY30 1321 aa16.22■□□□□ 0.19
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Akr1b10G5E895 316 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 115.6 ms