Protein–RNA interactions for Protein: A2AEI7

Tcp11x2, T-complex 11 family, X-linked 2, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp11x2A2AEI7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Tcp11x2A2AEI7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Tcp11x2A2AEI7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Tcp11x2A2AEI7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Tcp11x2A2AEI7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tcp11x2A2AEI7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Tcp11x2A2AEI7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tcp11x2A2AEI7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Tcp11x2A2AEI7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Tcp11x2A2AEI7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Tcp11x2A2AEI7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Tcp11x2A2AEI7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tcp11x2A2AEI7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tcp11x2A2AEI7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Tcp11x2A2AEI7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tcp11x2A2AEI7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tcp11x2A2AEI7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Tcp11x2A2AEI7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tcp11x2A2AEI7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tcp11x2A2AEI7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tcp11x2A2AEI7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tcp11x2A2AEI7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tcp11x2A2AEI7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tcp11x2A2AEI7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tcp11x2A2AEI7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Tcp11x2A2AEI7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tcp11x2A2AEI7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tcp11x2A2AEI7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tcp11x2A2AEI7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tcp11x2A2AEI7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tcp11x2A2AEI7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tcp11x2A2AEI7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tcp11x2A2AEI7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tcp11x2A2AEI7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Tcp11x2A2AEI7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tcp11x2A2AEI7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tcp11x2A2AEI7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tcp11x2A2AEI7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tcp11x2A2AEI7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tcp11x2A2AEI7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tcp11x2A2AEI7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tcp11x2A2AEI7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tcp11x2A2AEI7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tcp11x2A2AEI7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Tcp11x2A2AEI7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tcp11x2A2AEI7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Tcp11x2A2AEI7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tcp11x2A2AEI7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tcp11x2A2AEI7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Tcp11x2A2AEI7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tcp11x2A2AEI7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tcp11x2A2AEI7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tcp11x2A2AEI7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tcp11x2A2AEI7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tcp11x2A2AEI7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tcp11x2A2AEI7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tcp11x2A2AEI7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tcp11x2A2AEI7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tcp11x2A2AEI7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tcp11x2A2AEI7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tcp11x2A2AEI7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tcp11x2A2AEI7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tcp11x2A2AEI7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tcp11x2A2AEI7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tcp11x2A2AEI7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tcp11x2A2AEI7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tcp11x2A2AEI7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tcp11x2A2AEI7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tcp11x2A2AEI7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tcp11x2A2AEI7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tcp11x2A2AEI7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tcp11x2A2AEI7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tcp11x2A2AEI7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tcp11x2A2AEI7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Tcp11x2A2AEI7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Tcp11x2A2AEI7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tcp11x2A2AEI7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tcp11x2A2AEI7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tcp11x2A2AEI7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tcp11x2A2AEI7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tcp11x2A2AEI7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tcp11x2A2AEI7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcp11x2A2AEI7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tcp11x2A2AEI7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tcp11x2A2AEI7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcp11x2A2AEI7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tcp11x2A2AEI7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Tcp11x2A2AEI7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tcp11x2A2AEI7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tcp11x2A2AEI7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tcp11x2A2AEI7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tcp11x2A2AEI7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcp11x2A2AEI7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tcp11x2A2AEI7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tcp11x2A2AEI7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tcp11x2A2AEI7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tcp11x2A2AEI7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tcp11x2A2AEI7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tcp11x2A2AEI7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tcp11x2A2AEI7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms