Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cul1Q9WTX6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Cul1Q9WTX6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cul1Q9WTX6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cul1Q9WTX6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Cul1Q9WTX6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cul1Q9WTX6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cul1Q9WTX6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cul1Q9WTX6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cul1Q9WTX6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cul1Q9WTX6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cul1Q9WTX6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cul1Q9WTX6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cul1Q9WTX6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cul1Q9WTX6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cul1Q9WTX6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Cul1Q9WTX6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Cul1Q9WTX6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cul1Q9WTX6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cul1Q9WTX6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cul1Q9WTX6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cul1Q9WTX6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Cul1Q9WTX6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cul1Q9WTX6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cul1Q9WTX6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Cul1Q9WTX6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Cul1Q9WTX6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cul1Q9WTX6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cul1Q9WTX6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Cul1Q9WTX6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Cul1Q9WTX6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cul1Q9WTX6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cul1Q9WTX6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cul1Q9WTX6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cul1Q9WTX6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cul1Q9WTX6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cul1Q9WTX6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cul1Q9WTX6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Cul1Q9WTX6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cul1Q9WTX6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cul1Q9WTX6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cul1Q9WTX6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cul1Q9WTX6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cul1Q9WTX6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cul1Q9WTX6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Cul1Q9WTX6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cul1Q9WTX6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cul1Q9WTX6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cul1Q9WTX6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cul1Q9WTX6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cul1Q9WTX6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cul1Q9WTX6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Cul1Q9WTX6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cul1Q9WTX6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cul1Q9WTX6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cul1Q9WTX6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cul1Q9WTX6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cul1Q9WTX6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cul1Q9WTX6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cul1Q9WTX6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cul1Q9WTX6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cul1Q9WTX6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cul1Q9WTX6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cul1Q9WTX6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Cul1Q9WTX6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cul1Q9WTX6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cul1Q9WTX6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul1Q9WTX6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cul1Q9WTX6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cul1Q9WTX6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cul1Q9WTX6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cul1Q9WTX6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Cul1Q9WTX6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cul1Q9WTX6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cul1Q9WTX6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cul1Q9WTX6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cul1Q9WTX6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cul1Q9WTX6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cul1Q9WTX6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cul1Q9WTX6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cul1Q9WTX6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul1Q9WTX6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul1Q9WTX6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cul1Q9WTX6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cul1Q9WTX6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul1Q9WTX6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cul1Q9WTX6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cul1Q9WTX6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cul1Q9WTX6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cul1Q9WTX6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul1Q9WTX6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cul1Q9WTX6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cul1Q9WTX6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cul1Q9WTX6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul1Q9WTX6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul1Q9WTX6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cul1Q9WTX6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cul1Q9WTX6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cul1Q9WTX6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cul1Q9WTX6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms