RNA–Protein interactions for RNA: YPL147W

PXA1, Transcript of Subunit of a heterodimeric peroxisomal ABC transport complex, yeast

Gene PXA1, Length 2,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria, Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PXA1	YPL147W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	PHO2	P07269	559 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	MSS51	P32335	436 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	AEP1	P32493	518 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	SAF1	P38352	637 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	ATG7	P38862	630 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YJL171C	P46992	396 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	AAD10	P47182	288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	AIF1	P52923	378 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	IZH1	Q03419	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YPS7	Q06325	596 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	CYC3	P06182	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	PUT2	P07275	575 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	ERD2	P18414	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	MSN1	P22148	382 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	RNP1	P32385	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	COS8	P38723	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	HAT2	P39984	401 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	FMP52	P40008	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	ERG5	P54781	538 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	APS2	Q00381	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TVP18	Q04767	167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TPO4	Q12256	659 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TRM10	Q12400	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	CPT1	P17898	393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YCR023C	P25351	611 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	EHD3	P28817	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	RTC2	P38279	296 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	IKI1	P38874	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	GTS1	P40956	396 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TRS85	P46944	698 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	BNA5	Q05979	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YPT6	Q99260	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	COX2	P00410	251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	FUB1	P25659	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	SCM4	P32564	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TAT1	P38085	619 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	HXT13	P39924	564 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	HEM14	P40012	539 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	AVT6	P40074	448 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YJL016W	P47072	561 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	ERV14	P53173	138 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	HXT17	P53631	564 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	HXT15	P54854	567 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	PLB3	Q08108	686 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	LCB4	Q12246	624 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YLR046C	Q12253	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	GLN3	P18494	730 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	FRE1	P32791	686 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	PHD1	P36093	366 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YBR062C	P38239	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	ARN1	P38731	627 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	SOL3	P38858	249 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	VPS52	P39904	641 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	COG3	P40094	801 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
PXA1	YPL147W	HNT2	P49775	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YGR168C	P53293	376 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YPR003C	P53394	754 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	MRPL44	P19956	98 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	EPT1	P22140	391 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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