RNA–Protein interactions for RNA: YKL003C

MRP17, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP17, Length 396 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP17	YKL003C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SNC1	P31109	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	TFC1	P32367	649 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	PPG1	P32838	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	TRS65	P32893	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	MRPS5	P33759	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	RBG1	P39729	369 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YIL166C	P40445	542 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	NAS2	P40555	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	BRR6	P53062	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	MRPL19	P53875	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	TIM10	P87108	93 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YDR102C	Q03864	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YAP6	Q03935	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	HFD1	Q04458	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SPC24	Q04477	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SPC2	Q04969	178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	MED2	Q12124	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	HMS1	Q12398	434 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	ITR1	P30605	584 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	THI4	P32318	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	MSN4	P33749	630 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	GPX1	P36014	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	JEN1	P36035	616 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	YBR241C	P38142	488 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	MOB2	P43563	287 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	YNL095C	P53932	642 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	GTR1	Q00582	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	RRN5	Q02983	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	MED7	Q08278	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	SEC12	P11655	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	NUP1	P20676	1076 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	GIT1	P25346	518 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	PPA2	P28239	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	HCS1	P34243	683 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	YKL071W	P36086	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	YBR220C	P38318	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	YER084W	P40057	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	VHR1	P40522	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	YIL012W	P40551	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	IRC24	P40580	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	HMS2	P47175	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	DSL1	P53847	754 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	ACS1	Q01574	713 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	SPC3	Q12133	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	NFI1	Q12216	726 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	MHF1	Q3E835	90 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
MRP17	YKL003C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
MRP17	YKL003C	YBR063C	P38083	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	RTC2	P38279	296 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	FZO1	P38297	855 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	YBR197C	P38306	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	FET3	P38993	636 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
MRP17	YKL003C	QRI7	P43122	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	ASI1	P54074	624 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	RCE1	Q03530	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	DML1	Q03652	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	SSY1	Q03770	852 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	SNO4	Q04902	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	CTS2	Q06350	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	RSC58	Q07979	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	HSP32	Q08992	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	PRB1	P09232	635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	PTP2	P29461	750 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	CTF8	P38877	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	GPI8	P49018	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRP17	YKL003C	NIT3	P49954	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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