RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W YOR019WQ99248 730 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YER145C-AA0A023PYF4 145 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W ATP1P07251 545 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W COS2P0CX12 379 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W COS3P0CX13 379 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W ZWF1P11412 505 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W GLK1P17709 500 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RPS1BP23248 255 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RHB1P25378 209 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W MGR1P25573 417 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RPS1AP33442 255 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W DRE2P36152 348 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YBL029WP38201 376 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YMR262WP38430 313 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W FAD1P38913 306 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YER010CP40011 234 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W HMF1P40037 129 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W VRG4P40107 337 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W SLM1P40485 686 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W PTR3P43606 678 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RPE1P46969 238 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YJR030CP47101 745 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W HHO1P53551 258 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W KAP120Q02932 1032 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W PAL1Q05518 499 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RIF2Q06208 395 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W PHO92Q06390 306 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W POS5Q06892 414 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YPL199CQ08954 240 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YPR063CQ12160 140 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data3.58□□□□□ -1.84not detected
HCA4YJL033W YPL247CQ12523 523 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YPL119C-AQ3E751 87 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YOL159C-AQ3E769 90 aa3.58□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RIF1P29539 1916 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W IMA3P0CW40 589 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W IMA4P0CW41 589 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W POX1P13711 748 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W ECM25P32525 599 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W SRB6P32570 121 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W NOP4P37838 685 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W POP7P38291 140 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W GND1P38720 489 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W GEP4P38812 185 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W NSG1P38837 291 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W UTP25P40498 721 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W NSE4P43124 402 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RPS10BP46784 105 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W COX16P47081 118 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W LYS20P48570 428 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W NQM1P53228 333 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YNR068CP53754 272 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W OCA2P53949 197 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W MRPS16Q02608 121 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W PRM15Q03262 622 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RUB1Q03919 77 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YLR283WQ05867 314 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W GPI11Q06636 219 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W IMA2Q08295 589 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W SUS1Q6WNK7 96 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RIB3Q99258 208 aa3.57□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W THP2O13539 261 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W COX5AP00424 153 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W SCEIP03882 235 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W STE50P25344 346 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W PEX34P25584 144 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W NAM9P27929 486 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W LHP1P33399 275 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YPT52P36018 234 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W CHK1P38147 527 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YJR154WP47181 346 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W DOC1P53068 250 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W ERV14P53173 138 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YNR062CP53748 327 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YPL113CQ02961 396 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RCO1Q04779 684 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W NMD4Q12129 218 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W NBP2Q12163 236 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RPN5Q12250 445 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W PST2Q12335 198 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W PCC1Q3E833 88 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W LEU4P06208 619 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W CHO1P08456 276 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W PET54P10834 293 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W AMD1P15274 810 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W PUT4P15380 627 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W GLN3P18494 730 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W DAL81P21657 970 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W IFM1P25038 676 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W GAC1P28006 793 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W YIM1P28625 365 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W SDH3P33421 198 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W ERV15P38312 142 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W PSD1P39006 500 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W RMD8P43620 662 aa3.56□□□□□ -1.84
HCA4YJL033W MOG1P47123 218 aa3.56□□□□□ -1.84
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