RNA–Protein interactions for RNA: YHR120W

MSH1, Transcript of DNA-binding protein of the mitochondria, yeast

Gene MSH1, Length 2,880 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSH1	YHR120W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	CYK3	Q07533	885 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	SIR2	P06700	562 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	SPS2	P08459	502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	MCM7	P38132	845 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	CCZ1	P38273	704 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	ATG18	P43601	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YGR079W	P53249	370 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	RNH70	P53331	553 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	ERV29	P53337	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	ELP6	Q04868	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	GPN3	Q06543	272 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	MDM32	Q12171	622 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YPR015C	Q12531	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	SEC2	P17065	759 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	EMP70	P32802	667 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	BNA6	P43619	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	RPE1	P46969	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	BUD9	P53226	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	HOL1	P53389	586 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	DLT1	Q04216	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	TPO3	Q06451	622 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	ATG31	Q12421	196 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	TUL1	P36096	758 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	MRPL3	P36516	390 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YHR035W	P38769	630 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
MSH1	YHR120W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	PHM8	P40025	321 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	HXT9	P40885	567 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	IMO32	P53219	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YLR460C	P54007	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	VPS36	Q06696	566 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	MET2	P08465	486 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	SEC12	P11655	471 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	BAR1	P12630	587 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	SAC7	P17121	654 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	BIG1	P38813	335 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YEL068C	P39977	110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	CIN1	P40987	1014 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	AAD10	P47182	288 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	PLB2	Q03674	706 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	SEI1	Q06058	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	PSF1	Q12488	208 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSH1	YHR120W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	URA3	P03962	267 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	ARG80	P07249	177 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	STE12	P13574	688 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	SNF6	P18888	332 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	FPS1	P23900	669 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	AHC2	P25649	128 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YPT7	P32939	208 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	SRO77	P38163	1010 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	ANS1	P38832	159 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	RTT105	P40063	208 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YIL067C	P40514	678 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	QRI7	P43122	407 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	ATG4	P53867	494 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	OST6	Q03723	332 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	MSS11	Q03825	758 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	FRE5	Q08908	694 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	SNC1	P31109	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	NUD1	P32336	851 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	KRE6	P32486	720 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	YOR062C	P36025	268 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	SHE1	P38200	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	TAT2	P38967	592 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	SHR5	P41912	237 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	NUP57	P48837	541 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	COS10	P52924	374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	MNT4	P53745	580 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSH1	YHR120W	SPC19	Q03954	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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