RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480054.1

RABGAP1-210, Transcript of RAB GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGAP1, Length 423 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1-210ENST00000480054 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 REREQ9P2R6 1566 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 MAST1Q9Y2H9 1570 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 A0A0A6YYJ9 748 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 CAND2O75155 1236 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 CHGBP05060 677 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 ATF2P15336 505 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 KANK2Q63ZY3 851 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 MPZL3Q6UWV2 235 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 TPH2Q8IWU9 490 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 HAPLN2Q9GZV7 340 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 CSRNP2Q9H175 543 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 RBPJLQ9UBG7 517 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 NCOA1Q15788 1441 aa7.21□□□□□ -1.25
RABGAP1-210ENST00000480054 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 CUTAO60888 179 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 OPHN1O60890 802 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 SEMA7AO75326 666 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 APOL3O95236 402 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 LPLP06858 475 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 LPOP22079 712 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 LGALS4P56470 323 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 SPIDRQ14159 915 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 ACAP2Q15057 778 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 EDARQ9UNE0 448 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 A2MP01023 1474 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 AGLP35573 1532 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 PLXNC1O60486 1568 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 N4BP3O15049 544 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 ERC2O15083 957 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 IL33O95760 270 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 IL18BPO95998 194 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 C5AR1P21730 350 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 CDR1P51861 262 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 ITGA1P56199 1179 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 IL13RA1P78552 427 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 ADAM9Q13443 819 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 TCIRG1Q13488 830 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 CDYL2Q8N8U2 506 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 WDR48Q8TAF3 677 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 MZB1Q8WU39 189 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 MTG2Q9H4K7 406 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 PRDM12Q9H4Q4 367 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 KCND1Q9NSA2 647 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 SLC52A1Q9NWF4 448 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 FTSJ1Q9UET6 329 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 CDY2AQ9Y6F7 541 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 ADGRL2O95490 1459 aa7.19□□□□□ -1.26
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RABGAP1-210ENST00000480054 CYP7B1O75881 506 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 MC3RP41968 323 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 MAP3K12Q12852 859 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 DGKHQ86XP1 1220 aa7.19□□□□□ -1.26
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RABGAP1-210ENST00000480054 MIER2Q8N344 545 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 TTLL6Q8N841 843 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 KYQ8NBH2 561 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 TSPEARQ8WU66 669 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 FATE1Q969F0 183 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 CLIC6Q96NY7 704 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 DPP7Q9UHL4 492 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 FBXO10Q9UK96 956 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 ROCK1Q13464 1354 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 KIF15Q9NS87 1388 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGAP1-210ENST00000480054 NRP2O60462 931 aa7.18□□□□□ -1.26
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