RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 VCAM1P19320 739 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 IRF9Q00978 393 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 LAPTM5Q13571 262 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 FYB2Q5VWT5 728 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 MCTP1Q6DN14 999 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 FLAD1Q8NFF5 587 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 ZMAT4Q9H898 229 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 TOMM22Q9NS69 142 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 CLDND1Q9NY35 253 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 IGSF1Q8N6C5 1336 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 FGAP02671 866 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 COL6A2P12110 1019 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR19Q15760 415 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 PANK1Q8TE04 598 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 TTC17Q96AE7 1141 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 PIK3C2AO00443 1686 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 QRICH2Q9H0J4 1663 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 MYO1BO43795 1136 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 GDNFP39905 211 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF174Q15697 407 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 PNMA2Q9UL42 364 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
STRADBP1-201ENST00000478954 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 RASSF10A6NK89 507 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 NOTOA8MTQ0 251 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 MAN2B1O00754 1011 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 KDM1AO60341 852 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 C5AR1P21730 350 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 AKAP5P24588 427 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 KIF11P52732 1056 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 SEC23AQ15436 765 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 SKAP1Q86WV1 359 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 TICAM2Q86XR7 235 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 GJA10Q969M2 543 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 MAP6Q96JE9 813 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 KIF1BO60333 1816 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A0C4DFX4 3053 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 DAPK1P53355 1430 aa6.95□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa6.95□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.95□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 NRDCO43847 1150 aa6.95□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 HPXP02790 462 aa6.95□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 MYL3P08590 195 aa6.95□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 GNAT1P11488 350 aa6.95□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC5A1P13866 664 aa6.95□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 RHCEP18577 417 aa6.95□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 FPR2P25090 351 aa6.95□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 TRAPPC10P48553 1259 aa6.95□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 RHDQ02161 417 aa6.95□□□□□ -1.3
STRADBP1-201ENST00000478954 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.95□□□□□ -1.3
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