RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 HCSTQ9UBK5 93 aa26.61■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 PLAGL2Q9UPG8 496 aa26.61■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 MYO7AQ13402 2215 aa26.61■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA1671Q9BY89 1806 aa26.6■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 CUL9Q8IWT3 2517 aa26.6■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa26.6■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 CDC25AP30304 524 aa26.6■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 RAB27AP51159 221 aa26.6■■□□□ 1.85
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SMKR1-201ENST00000462322 BHMT2Q9H2M3 363 aa26.6■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.6■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 COG5Q9UP83 839 aa26.6■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 DLL1O00548 723 aa26.59■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 ITGB1P05556 798 aa26.59■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 CYP11B2P19099 503 aa26.59■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
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SMKR1-201ENST00000462322 LRRC43Q8N309 656 aa26.59■■□□□ 1.85
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SMKR1-201ENST00000462322 CWH43Q9H720 699 aa26.59■■□□□ 1.85
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SMKR1-201ENST00000462322 LRRIQ4A6NIV6 560 aa26.58■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF623O75123 536 aa26.58■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 CSPG5O95196 566 aa26.58■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 LAG3P18627 525 aa26.58■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 TFF2Q03403 129 aa26.58■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 MBTD1Q05BQ5 628 aa26.58■■□□□ 1.85
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SMKR1-201ENST00000462322 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa26.58■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 SPPL3Q8TCT6 385 aa26.58■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 LPPQ93052 612 aa26.58■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 ASB2Q96Q27 587 aa26.58■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 NFKBIZQ9BYH8 718 aa26.58■■□□□ 1.85
SMKR1-201ENST00000462322 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
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SMKR1-201ENST00000462322 TSPAN1O60635 241 aa26.57■■□□□ 1.84
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SMKR1-201ENST00000462322 TCEAL5Q5H9L2 206 aa26.57■■□□□ 1.84
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC55Q6ZSA7 311 aa26.57■■□□□ 1.84
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SMKR1-201ENST00000462322 GLB1LQ6UWU2 654 aa26.55■■□□□ 1.84
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SMKR1-201ENST00000462322 AMHR2Q16671 573 aa26.54■■□□□ 1.84
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SMKR1-201ENST00000462322 BSNDQ8WZ55 320 aa26.54■■□□□ 1.84
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SMKR1-201ENST00000462322 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
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SMKR1-201ENST00000462322 DEPTORQ8TB45 409 aa26.52■■□□□ 1.84
SMKR1-201ENST00000462322 KIFAP3Q92845 792 aa26.52■■□□□ 1.84
SMKR1-201ENST00000462322 TTC28Q96AY4 2481 aa26.52■■□□□ 1.84
SMKR1-201ENST00000462322 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa26.52■■□□□ 1.84
SMKR1-201ENST00000462322 IFT74Q96LB3 600 aa26.52■■□□□ 1.84
SMKR1-201ENST00000462322 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SMKR1-201ENST00000462322 NT5C3AQ9H0P0 336 aa26.52■■□□□ 1.84
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