RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	CBP1	P07252	654 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	SPE1	P08432	466 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	SPS2	P08459	502 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	STE18	P18852	110 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	CWP1	P28319	239 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	AEP1	P32493	518 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	SOL2	P37262	315 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	RIB1	P38066	345 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	SLM4	P38247	162 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	IST2	P38250	946 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	ARN1	P38731	627 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	PSD1	P39006	500 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	YEL020C	P39994	560 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	HXT9	P40885	567 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	AIM22	P47051	409 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	AIF1	P52923	378 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	HHO1	P53551	258 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	BOR1	P53838	576 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	YNL184C	P53876	108 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	HLR1	Q04429	423 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	DPP1	Q05521	289 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	YPL199C	Q08954	240 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	BTS1	Q12051	335 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	SPC3	Q12133	184 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	YPL066W	Q12194	479 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	SVS1	Q12254	260 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	CTF3	Q12748	733 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	ECM3	Q99252	613 aa		5.18	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	PDR11	P40550	1411 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	SAG1	P20840	650 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	COS9	P36034	407 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	HXT13	P39924	564 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	OXA1	P39952	402 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	COG3	P40094	801 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	TIR3	P40552	269 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	HOC1	P47124	396 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	YJR096W	P47137	282 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	YPT11	P48559	417 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	TPP1	Q03796	238 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	AIM36	Q03798	255 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	RRG8	Q06109	277 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	TMA10	Q06177	86 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	XYL2	Q07993	356 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	TPO4	Q12256	659 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		5.17	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	MBR1	P23493	339 aa		5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.16	□□□□□ -1.58	not detected
VBA1	YMR088C	HES1	P35843	434 aa		5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	PHD1	P36093	366 aa		5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	RCK1	P38622	512 aa		5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	YHR078W	P38799	552 aa		5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	MLH1	P38920	769 aa		5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	GLC8	P41818	229 aa		5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	SPG5	P42933	373 aa		5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	NSE4	P43124	402 aa		5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	ASG7	P46993	209 aa		5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	UBC12	P52491	188 aa		5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	SIZ1	Q04195	904 aa		5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	ATG33	Q06485	197 aa		5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	GUD1	Q07729	489 aa		5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	PER33	Q12144	273 aa		5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	SNF2	P22082	1703 aa		5.16	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	REP2	P03872	296 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	GAL80	P04387	435 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	PHO2	P07269	559 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		5.15	□□□□□ -1.58
VBA1	YMR088C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.3 ms