RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W YJL107CP42947 387 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W SET4P42948 560 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YJR096WP47137 282 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W RRP45Q05636 305 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W ATG39Q06159 398 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W RRI1Q12468 440 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W VMR1P38735 1592 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W SPS2P08459 502 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W UBC8P28263 218 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W SRB5P32585 307 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YPC1P38298 316 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W WSC4P38739 605 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YHR097CP38809 366 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W PFS1P38872 237 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W PUG1P40100 303 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W PAN6P40459 309 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W FMC1P40491 155 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W SMK1P41808 388 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W SBH2P52871 88 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W YGL138CP53122 345 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W THI20Q08224 551 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W MED11Q99278 115 aa4.84□□□□□ -1.63
CYK3YDL117W URB1P34241 1764 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W TPK3P05986 398 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W SAC7P17121 654 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W OLE1P21147 510 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W AEP1P32493 518 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W GPX2P38143 162 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W HIS2P38635 335 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W ARP1P38696 384 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W FIR1P40020 876 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W COG3P40094 801 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W BUD13P46947 266 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W PHB2P50085 310 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W AIF1P52923 378 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W COS10P52924 374 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W TRM44Q02648 567 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W SNO1Q03144 224 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YDR132CQ03900 495 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W AIM33Q04516 312 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YLR046CQ12253 270 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W TFC7Q12415 435 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W RTN2Q12443 393 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W SLO1Q3E784 85 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W HTS1P07263 546 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W GUK1P15454 187 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W RPB10P22139 70 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W BUB3P26449 341 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W TIP20P33891 701 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YKR075CP36155 307 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W APT2P36973 181 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YBR197CP38306 217 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W DER1P38307 211 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W PRS3P38689 320 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W PRP39P39682 629 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W FMP52P40008 231 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W COX15P40086 486 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W GAT2P40209 560 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W VNX1P42839 908 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YJR012CP47087 207 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YGL185CP53100 379 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W CDC55Q00362 526 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W SPP2Q02521 185 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W GIS4Q04233 774 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YLR407WQ06070 228 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W THI72Q08579 599 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YIR021W-AQ3E739 70 aa4.83□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W TPI1P00942 248 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W BI2P03873 423 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W PHD1P36093 366 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W TAT1P38085 619 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YEL020CP39994 560 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W ASG7P46993 209 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W NUP57P48837 541 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W ASN2P49090 572 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W AVT4P50944 713 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W CPR8P53728 308 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W BOR1P53838 576 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W KIN4Q01919 800 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YPL067CQ02754 198 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W TDA1Q03533 586 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YMR210WQ03649 449 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W ECM30Q06673 1274 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W HIM1Q06674 414 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W FSF1Q12029 327 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W POM33Q12164 279 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W RKI1Q12189 258 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YPL066WQ12194 479 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YLR108CQ12259 485 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W RIB3Q99258 208 aa4.82□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W FLP1P03870 423 aa4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 84.3 ms