RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 PLCB3Q01970 1234 aa13.15□□□□□ -0.3
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CAPNS1-209ENST00000590049 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
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CAPNS1-209ENST00000590049 SLC39A7Q92504 469 aa13.13□□□□□ -0.31
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CAPNS1-209ENST00000590049 DNERQ8NFT8 737 aa13.12□□□□□ -0.31
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CAPNS1-209ENST00000590049 MKNK1Q9BUB5 465 aa13.12□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 SFXN1Q9H9B4 322 aa13.12□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 LTB4R2Q9NPC1 389 aa13.12□□□□□ -0.31
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CAPNS1-209ENST00000590049 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
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CAPNS1-209ENST00000590049 PLEKHA8P1O95397 391 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 DEXIO95424 95 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 GNAT1P11488 350 aa13.11□□□□□ -0.31
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CAPNS1-209ENST00000590049 EPCAMP16422 314 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 LAG3P18627 525 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 SMARCA1P28370 1054 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 KRT17Q04695 432 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 ST3GAL1Q11201 340 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 LAMC2Q13753 1193 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 TRIM29Q14134 588 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 KIAA1211LQ6NV74 962 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC30A10Q6XR72 485 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 SEPT14Q6ZU15 432 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 STAG2Q8N3U4 1231 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 GLG1Q92896 1179 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 PHKBQ93100 1093 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-209ENST00000590049 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
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