RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480416.1

TNS1-215, Transcript of tensin 1, human

TSL 2

Gene TNS1, Length 335 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNS1-215	ENST00000480416	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
TNS1-215	ENST00000480416	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TNS1-215	ENST00000480416	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		3.9	□□□□□ -1.78
TNS1-215	ENST00000480416	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.78
TNS1-215	ENST00000480416	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	LRRN2	O75325	713 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	CIAO1	O76071	339 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	MMP1	P03956	469 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	ITGB1	P05556	798 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	PROS1	P07225	676 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	EDN3	P14138	238 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	CYP7A1	P22680	504 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	SNAP25	P60880	206 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	ICA1	Q05084	483 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	MTMR3	Q13615	1198 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	C8orf34	Q49A92	452 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	FDX2	Q6P4F2	183 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	TTC6	Q86TZ1	520 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	3.9	□□□□□ -1.79	4e-29	■■■■■ 102.1
TNS1-215	ENST00000480416	FIBCD1	Q8N539	461 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	CEP120	Q8N960	986 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	CAGE1	Q8TC20	777 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	POF1B	Q8WVV4	589 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	EDEM1	Q92611	657 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	RTKN	Q9BST9	563 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	EHD4	Q9H223	541 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	POMK	Q9H5K3	350 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	SPTBN2	O15020	2390 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	TAF4	O00268	1085 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	ZBTB39	O15060	712 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	PAX4	O43316	350 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	FAM13A	O94988	1023 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	ARIH2	O95376	493 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	RB1	P06400	928 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	GLUL	P15104	373 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	SPINK2	P20155	84 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	EPHA1	P21709	976 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	PML	P29590	882 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	CDC25B	P30305	580 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	SSTR4	P31391	388 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	TEC	P42680	631 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	ERVFC1	P60507	584 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	DMWD	Q09019	674 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	KCNC3	Q14003	757 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	RNF43	Q68DV7	783 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	IL17RA	Q96F46	866 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	MYRFL	Q96LU7	910 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	ALG1	Q9BT22	464 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	NCDN	Q9UBB6	729 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TNS1-215	ENST00000480416	USP18	Q9UMW8	372 aa		3.89	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms