RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264938.7

SLC9A3-201, Transcript of solute carrier family 9 member A3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC9A3, Length 2,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3-201ENST00000264938 TMEM109Q9BVC6 243 aa25.09■■□□□ 1.61
SLC9A3-201ENST00000264938 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SLC9A3-201ENST00000264938 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa25.09■■□□□ 1.61
SLC9A3-201ENST00000264938 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa25.09■■□□□ 1.61
SLC9A3-201ENST00000264938 SUN1O94901 812 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3-201ENST00000264938 BLMHQ13867 455 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3-201ENST00000264938 RMDN2Q96LZ7 410 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3-201ENST00000264938 NT5C3AQ9H0P0 336 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3-201ENST00000264938 STAT3P40763 770 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3-201ENST00000264938 MARCKSL1P49006 195 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3-201ENST00000264938 PPP2R5EQ16537 467 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3-201ENST00000264938 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3-201ENST00000264938 PALB2Q86YC2 1186 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3-201ENST00000264938 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3-201ENST00000264938 YIPF3Q9GZM5 350 aa25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3-201ENST00000264938 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SLC9A3-201ENST00000264938 TMEM253P0C7T8 217 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 SARNPP82979 210 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 BTNL9Q6UXG8 535 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 THAP2Q9H0W7 228 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 RASAL2Q9UJF2 1139 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 TMEM120BA0PK00 339 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 CLIC2O15247 247 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 MED24O75448 989 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 LINGO3P0C6S8 592 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 FERP16591 822 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 CALRP27797 417 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 RFC4P35249 363 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 SLC12A3P55017 1021 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 TAOK1Q7L7X3 1001 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 NEDD1Q8NHV4 660 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 PARD3BQ8TEW8 1205 aa25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 KRT35Q92764 455 aa25.07■■□□□ 1.6
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SLC9A3-201ENST00000264938 PHF2O75151 1096 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 POTEIP0CG38 1075 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 SMARCA1P28370 1054 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 MGAT5Q09328 741 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 POTEGQ6S5H5 508 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 VSTM1Q6UX27 236 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 CCDC25Q86WR0 208 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 GJB6O95452 261 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 GH1P01241 217 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 STAT1P42224 750 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 PSMC6P62333 389 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 SFR1Q86XK3 245 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 ANKRD42Q8N9B4 389 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 ANKLE1Q8NAG6 615 aa25.06■■□□□ 1.6
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SLC9A3-201ENST00000264938 ZBTB10Q96DT7 871 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 IKZF4Q9H2S9 585 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 NT5C2P49902 561 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 KCNA1Q09470 495 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 SPATA21Q7Z572 469 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 PFASO15067 1338 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 MPP2Q14168 576 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 HOMER3Q9NSC5 361 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 PRKAG3Q9UGI9 489 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 A6NHS1 94 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 RARGP13631 454 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 SOX5P35711 763 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 ICA1Q05084 483 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 GIT2Q14161 759 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 MFSD5Q6N075 450 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 CGB2Q6NT52 195 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 SLC51AQ86UW1 340 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 EGFL6Q8IUX8 553 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
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SLC9A3-201ENST00000264938 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.04■■□□□ 1.6
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SLC9A3-201ENST00000264938 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 ITPK1Q13572 414 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 SLC17A8Q8NDX2 589 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 SYT11Q9BT88 431 aa25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3-201ENST00000264938 GPCPD1Q9NPB8 672 aa25.04■■□□□ 1.6
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