RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A LIP5P32875 414 aa1.85□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A KTR7P40504 517 aa1.85□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A MET1P36150 593 aa1.85□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A RGR1P19263 1082 aa1.84□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A BOI2P39969 1040 aa1.84□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A SSA2P10592 639 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
YPL060C-AYPL060C-A RTF1P53064 558 aa1.84□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A FPK1P53739 893 aa1.84□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A GLY1P37303 387 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A MET32Q12041 191 aa1.83□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A RPA14P50106 137 aa1.83□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A ECM2P38241 364 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A LYS5P50113 272 aa1.83□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data1.83□□□□□ -2.12not detected
YPL060C-AYPL060C-A STE20Q03497 939 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A ITT1Q04638 464 aa1.83□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A YPR053CQ6Q5F3 151 aa1.83□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A FPS1P23900 669 aa1.82□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A ORC6P38826 435 aa1.82□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A ICP55P40051 511 aa1.82□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A UTP7P40055 554 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A RTT106P40161 455 aa1.82□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A KRE33P53914 1056 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A YMR187CQ03236 431 aa1.82□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A ADE12P80210 433 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A AAD14P42884 376 aa1.81□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A MSB3P48566 633 aaPredicted RBP1.81□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A PDC1P06169 563 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A ATG20Q07528 640 aa1.81□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A YIR007WP40566 764 aa1.8□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A NST1P53935 1240 aa1.8□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A DPH6Q12429 685 aa1.8□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A CWH41P53008 833 aa1.8□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A YMR074CQ04773 145 aa1.79□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A HPF1Q05164 967 aa1.79□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A STB3Q12427 513 aa1.79□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A OMA1P36163 345 aa1.79□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A YJU3P28321 313 aa1.79□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A FOL2P51601 243 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A NIS1P53939 407 aa1.79□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A YPR097WQ06839 1073 aa1.78□□□□□ -2.12
YPL060C-AYPL060C-A RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A DIT2P21595 489 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-DR4O74302 440 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-AP0CX57 440 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-PR1P0CX58 440 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-ORP0CX59 440 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-PR2P0CX60 440 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-DR5P0CX65 440 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-ER2P0CX66 440 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-GR3P0CX67 440 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-LR1P0CX68 440 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-MR2P0CX69 440 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A SDH2P21801 266 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A YFL034WP43564 1073 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A YJL007CP47080 104 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-JR2P47099 440 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A YJR098CP47139 656 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-DR1Q03856 440 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-BRQ12217 440 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-NL2Q12470 440 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-GR2Q12485 440 aa1.77□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A ROG3P43602 733 aa1.76□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A YPP1P46951 817 aa1.76□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A ALO1P54783 526 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A YDR090CQ03193 310 aa1.76□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A ISR1Q06098 443 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A YBR287WP38355 427 aa1.76□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A RAD59Q12223 238 aa1.76□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A ALG14P38242 237 aa1.75□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A MTO1P53070 669 aa1.75□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A ISF1P32488 338 aa1.74□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A SOH1P38633 127 aa1.74□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data1.74□□□□□ -2.13not detected
YPL060C-AYPL060C-A SEC2P17065 759 aa1.74□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A MDJ1P35191 511 aa1.73□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A YJL181WP46987 611 aa1.73□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A WTM2Q12206 467 aa1.73□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A YKL222CP35995 705 aa1.73□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A OSH7P38755 437 aa1.73□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A HST2P53686 357 aa1.73□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A FOX2Q02207 900 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A ACO2P39533 789 aa1.72□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A EMP47P43555 445 aa1.72□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A AKR1P39010 764 aa1.72□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A IRC24P40580 263 aa1.72□□□□□ -2.13
YPL060C-AYPL060C-A NCL1P38205 684 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A FIR1P40020 876 aa1.71□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A YNR021WP53723 404 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A MRPL16P38064 232 aa1.71□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A YNL108CP53929 270 aa1.71□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A TDA6Q06466 467 aa1.71□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A KIN1P13185 1064 aa1.7□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A FBP26P32604 452 aa1.7□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A MSH6Q03834 1242 aa1.7□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-BLQ12266 440 aa1.7□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-MR1Q04215 440 aa1.69□□□□□ -2.14
YPL060C-AYPL060C-A FIG4P42837 879 aa1.69□□□□□ -2.14
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